Coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2

Le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère ( SRAS‐CoV‐2 ) ^[2] est une souche de coronavirus qui cause la COVID-19 (maladie à coronavirus 2019), la Maladie respiratoire responsable de la pandémie actuelle de COVID-19 . ^[3] Le virus avait auparavant un nom provisoire , nouveau coronavirus 2019 ( 2019-nCoV ), ^{[4] [5] [6] [7]} et a également été appelé coronavirus humain 2019 ( HCoV-19 ou hCoV-19 ). ^{[8] [9] [10][11]} Identifiée pour la première fois dans la ville de Wuhan , Hubei , Chine, l’ Organisation mondiale de la santé a déclaré l’épidémie une urgence de santé publique de portée internationale le 30 janvier 2020 et une pandémie le 11 mars 2020. ^{[12] [13]} SRAS‐ Le CoV‐2 est un Virus à ARN simple brin de sens positif ^[14] qui est contagieux chez l’homme. ^[15]

Coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2
Micrographie électronique à transmission colorisée des virions du SRAS-CoV-2 avec coronae visible
(non classé):	Virus
Royaume :	Ribovirie
Royaume:	Orthornavires
Phylum:	Pisuviricota
Classe:	Pisoniviricètes
Commande:	Nidovirales
Famille:	Coronaviridés
Genre:	Bêtacoronavirus
Sous-genre :	Sarbecovirus
Espèces:	Coronavirus lié au syndrome respiratoire aigu sévère
Virus:	Coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2
Variantes notables
Alpha (B.1.1.7) Bêta (B.1.351) Gamma (P.1) Delta (B.1.617.2) Omicron (B.1.1.529) Liste complète
Synonymes
2019-nCoV

Le SARS‐CoV‐2 est un virus de l’espèce coronavirus lié au syndrome respiratoire aigu sévère (SARSr-CoV), apparenté au virus SARS-CoV-1 qui a provoqué l’ épidémie de SRAS de 2002 à 2004 . ^{[2] [16]} Il est d’ origine zoonotique et présente une similitude génétique étroite avec les coronavirus de chauve-souris, ce qui suggère qu’il a émergé d’un virus transmis par les chauves-souris . ^{[9] [17]} Des recherches sont en cours pour savoir si le SRAS-CoV-2 provient directement des chauves-souris ou indirectement via des hôtes intermédiaires. ^[18] Le virus montre peu de diversité génétique , ce qui indique que l’ événement de débordementl’introduction du SRAS-CoV-2 chez l’homme est susceptible d’avoir eu lieu fin 2019. ^[19]

Des études épidémiologiques estiment que, sur la période de décembre 2019 à septembre 2020, chaque infection a entraîné en moyenne 2,4 à 3,4 nouvelles infections lorsqu’aucun membre de la communauté n’est immunisé et qu’aucune mesure préventive n’est prise. ^[20] Cependant, certaines variantes ultérieures sont devenues plus contagieuses. ^[21] Le virus se propage principalement entre les personnes par contact étroit et via des aérosols et des gouttelettes respiratoires qui sont expirés lors de la conversation, de la respiration ou de l’expiration, ainsi que ceux produits par la toux ou les éternuements. ^{[22] [23]} Il pénètre dans les cellules humaines en se liant à l’ enzyme de conversion de l’angiotensine 2(ACE2), une protéine membranaire qui régule le système rénine-angiotensine. ^{[24] [25]}

Terminologie

Signer avec le nom provisoire “2019-nCoV”

Lors de l’épidémie initiale à Wuhan , en Chine, divers noms ont été utilisés pour le virus ; certains noms utilisés par différentes sources comprenaient “le coronavirus” ou “Wuhan coronavirus”. ^{[26] [27]} En janvier 2020, l’ Organisation mondiale de la santé (OMS) a recommandé « 2019 novel coronavirus » (2019-nCov) ^{[5] [28]} comme nom provisoire du virus. Cela était conforme aux directives de l’OMS de 2015 ^[29] contre l’utilisation de lieux géographiques, d’espèces animales ou de groupes de personnes dans les noms de maladies et de virus. ^{[30] [31]}

Le 11 février 2020, le Comité international de taxonomie des virus a adopté le nom officiel « coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 » (SARS‐CoV‐2). ^[32] Pour éviter toute confusion avec la maladie du SRAS , l’OMS fait parfois référence au SRAS-CoV-2 comme “le virus COVID-19” dans les communications de santé publique ^{[33] [34]} et le nom HCoV-19 a été inclus dans certaines recherches des articles. ^{[8] [9] [10]} Se référant à COVID-19 comme le “virus de Wuhan” a été décrit comme dangereux par les responsables de l’OMS et comme xénophobe par l’Université de Californie à Berkeley, le conférencier en études asiatiques américaines Harvey Dong. ^{[35] [36] [37]}

Infection et transmission

Cette section a plusieurs problèmes. Aidez -nous à l’améliorer ou discutez de ces problèmes sur la page de discussion . ( Apprenez comment et quand supprimer ces modèles de messages ) Cette rubrique doit être mise à jour . Please help update this article to reflect recent events or newly available information. (August 2021) This section needs more medical references for verification or relies too heavily on primary sources. Please review the contents of the section and add the appropriate references if you can. Unsourced or poorly sourced material may be challenged and removed. Find sources: “Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2” – news · newspapers · books · scholar · JSTOR (August 2021) (Learn how and when to remove this template message)

La transmission interhumaine du SRAS‐CoV‐2 a été confirmée le 20 janvier 2020 lors de la pandémie de COVID-19 . ^{[15] [38] [39] [40]} On a initialement supposé que la transmission se produisait principalement via des gouttelettes respiratoires provenant de la toux et des éternuements dans un rayon d’environ 1,8 mètre (6 pieds). ^{[41] [42]} Les expériences de diffusion de la lumière laser suggèrent que la parole est un mode de transmission supplémentaire ^{[43] [44]} et de grande portée ^[45] , à l’intérieur, avec peu de flux d’air. ^{[46] [47]} D’autres études ont suggéré que le virus pourrait être aéroportéde même, les aérosols pouvant potentiellement transmettre le virus. ^{[48] ​​[49] [50]} Au cours de la transmission interhumaine, on pense qu’entre 200 et 800 virions infectieux du SRAS‐CoV‐2 déclenchent une nouvelle infection. ^{[51] [52] [53]} Si elle est confirmée, la transmission par aérosol a des implications sur la biosécurité car une préoccupation majeure associée au risque de travailler avec des virus émergents en laboratoire est la génération d’aérosols provenant de diverses activités de laboratoire qui ne sont pas immédiatement reconnaissables et peuvent affecter autre personnel scientifique. ^[54] Le contact indirect via des surfaces contaminées est une autre cause possible d’infection. ^[55]Des recherches préliminaires indiquent que le virus peut rester viable sur du plastique ( polypropylène ) et de l’acier inoxydable ( AISI 304 ) jusqu’à trois jours, mais il ne survit pas sur du carton plus d’un jour ou sur du cuivre plus de quatre heures. ^[10] Le virus est inactivé par le savon, qui déstabilise sa bicouche lipidique . ^{[56] [57]} L’ ARN viral a également été trouvé dans des échantillons de selles et du sperme d’individus infectés. ^{[58] [59]}

Le degré auquel le virus est infectieux pendant la période d’incubation est incertain, mais la recherche a indiqué que le pharynx atteint une charge virale maximale environ quatre jours après l’infection ^{[60] [61]} ou dans la première semaine de symptômes et décline par la suite. ^[62] La durée de l’excrétion de l’ARN du SRAS-CoV-2 est généralement comprise entre 3 et 46 jours après l’apparition des symptômes. ^[63]

Une étude menée par une équipe de chercheurs de l’ Université de Caroline du Nord a révélé que la cavité nasale est apparemment le site initial dominant de l’infection, avec un ensemencement ultérieur du virus par aspiration dans les poumons dans la pathogenèse du SRAS‐CoV‐2. ^[64] Ils ont découvert qu’il existait un gradient d’infection allant de haut dans les cultures proximales vers basses dans les cultures épithéliales pulmonaires distales, avec une infection focale dans les cellules ciliées et les pneumocytes de type 2 dans les voies respiratoires et les régions alvéolaires respectivement. ^[64]

Des études ont identifié une gamme d’animaux – tels que les chats, les furets, les hamsters, les primates non humains, les visons, les musaraignes arboricoles, les chiens viverrins, les chauves-souris frugivores et les lapins – qui sont sensibles et permissifs à l’infection par le SRAS-CoV-2. ^{[65] [66] [67]} Certaines institutions ont conseillé aux personnes infectées par le SARS‐CoV‐2 de restreindre leur contact avec les animaux. ^{[68] [69]}

Transmission asymptomatique et présymptomatique

Le 1er février 2020, l’ Organisation mondiale de la santé (OMS) a indiqué que “la transmission à partir de cas asymptomatiques n’est probablement pas un facteur majeur de transmission”. ^[70] Une méta-analyse a révélé que 17 % des infections sont asymptomatiques et que les personnes asymptomatiques étaient 42 % moins susceptibles de transmettre le virus. ^[71]

Cependant, un modèle épidémiologique du début de l’ épidémie en Chine a suggéré que “l’ excrétion pré-symptomatique peut être typique parmi les infections documentées” et que les infections subcliniques peuvent avoir été à l’origine de la majorité des infections. ^[72] Cela peut expliquer comment sur 217 à bord d’un paquebot de croisière qui a accosté à Montevideo , seuls 24 des 128 qui ont été testés positifs pour l’ARN viral ont montré des symptômes. ^[73]De même, une étude portant sur quatre-vingt-quatorze patients hospitalisés en janvier et février 2020 a estimé que les patients ont commencé à excréter le virus deux à trois jours avant l’apparition des symptômes et qu'”une proportion substantielle de la transmission s’est probablement produite avant les premiers symptômes chez le cas index “. ^[74] Les auteurs ont publié plus tard une correction qui a montré que l’excrétion a commencé plus tôt que prévu, quatre à cinq jours avant l’apparition des symptômes. ^[75]

Réinfection

Il existe une incertitude quant à la réinfection et à l’immunité à long terme. ^[76] On ne sait pas à quel point la réinfection est courante, mais des rapports ont indiqué qu’elle se produit avec une gravité variable. ^[76]

Le premier cas de réinfection signalé était un homme de 33 ans de Hong Kong qui a été testé positif pour la première fois le 26 mars 2020, a été libéré le 15 avril 2020 après deux tests négatifs et a de nouveau été testé positif le 15 août 2020 (142 jours plus tard) , ce qui a été confirmé par le séquençage du génome entier montrant que les génomes viraux entre les épisodes appartiennent à des clades différents . ^[77] Les résultats ont eu pour conséquence que l’immunité collective pourrait ne pas éliminer le virus si la réinfection n’est pas rare et que les vaccins pourraient ne pas être en mesure de fournir une protection à vie contre le virus. ^[77]

Une autre étude de cas a décrit un homme de 25 ans du Nevada qui a été testé positif au SRAS‐CoV‐2 le 18 avril 2020 et le 5 juin 2020 (séparés par deux tests négatifs). Étant donné que les analyses génomiques ont montré des différences génétiques significatives entre la variante du SRAS-CoV-2 échantillonnée à ces deux dates, les auteurs de l’étude de cas ont déterminé qu’il s’agissait d’une réinfection. ^[78] La deuxième infection de l’homme était symptomatiquement plus grave que la première infection, mais les mécanismes qui pourraient expliquer cela ne sont pas connus. ^[78]

Réservoir et origine

Transmission du SARS-CoV-1 et du SARS‐CoV‐2 des mammifères en tant que vecteurs biologiques à l’homme

Les premières infections connues par le SRAS‐CoV‐2 ont été découvertes à Wuhan, en Chine. ^[17] La ​​source originale de transmission virale aux humains reste incertaine, tout comme si le virus est devenu pathogène avant ou après l’ événement de débordement . ^{[9] [19] [79]} Parce que bon nombre des premiers infectés étaient des travailleurs du marché des fruits de mer de Huanan , ^{[80] [81]} il a été suggéré que le virus pourrait provenir du marché. ^{[9] [82]} Cependant, d’autres recherches indiquent que les visiteurs peuvent avoir introduit le virus sur le marché, ce qui a ensuite facilité l’expansion rapide des infections. ^{[19] [83]}Un rapport rédigé par l’OMS en mars 2021 a déclaré que le débordement humain via un hôte animal intermédiaire était l’explication la plus probable, le débordement direct des chauves-souris étant le plus probable. L’introduction par la chaîne d’approvisionnement alimentaire et le marché des fruits de mer de Huanan a été considérée comme une autre explication possible, mais moins probable. ^[84] Une analyse en novembre 2021, cependant, a indiqué que le premier cas connu avait été mal identifié et que la prépondérance des premiers cas liés au marché de Huanan plaidait pour qu’il en soit la source. ^[85]

Pour un virus récemment acquis par transmission interspécifique, une évolution rapide est attendue. ^[86] Le taux de mutation estimé à partir des premiers cas de SRAS-CoV-2 était de6,54 × 10 ⁻⁴ par site par an. ^[84] Les coronavirus ont en général une plasticité génétique élevée , ^[87] mais l’évolution virale du SRAS-CoV-2 est ralentie par la capacité de relecture de l’ARN de sa machinerie de réplication. ^[88] À titre de comparaison, le taux de mutation virale in vivo du SRAS-CoV-2 s’est avéré inférieur à celui de la grippe. ^[89]

La recherche sur le réservoir naturel du virus à l’origine de l’ épidémie de SRAS de 2002 à 2004 a abouti à la découverte de nombreux coronavirus de chauve-souris de type SRAS , la plupart provenant de chauves- souris en fer à cheval . La correspondance la plus proche de loin, publiée sur Nature (journal) en février 2022, était les virus BANAL-52 (ressemblance à 96,8 % avec le SARS-CoV-2), BANAL-103 et BANAL-236, collectés chez trois espèces différentes de chauves-souris à Feuang , Laos. ^{[90] [91] [92]} Une source antérieure publiée en février 2020 a identifié le virus RaTG13 , collecté chez des chauves-souris à Mojiang, Yunnan, Chine comme étant le plus proche du SRAS‐CoV‐2, avec une ressemblance de 96,1 %. ^{[17] [93]} Aucun de ce qui précède n’est son ancêtre direct. ^[94]

Des échantillons prélevés sur Rhinolophus sinicus , une espèce de chauves- souris fer à cheval , montrent une ressemblance à 80 % avec le SARS‐CoV‐2.

Les chauves-souris sont considérées comme le réservoir naturel le plus probable du SRAS‐CoV‐2. ^{[84] [95]} Les différences entre le coronavirus de chauve-souris et le SARS-CoV-2 suggèrent que les humains peuvent avoir été infectés via un hôte intermédiaire ; ^[82] bien que la source d’introduction chez l’homme reste inconnue. ^{[96] [97]}

Bien que le rôle des Pangolins en tant qu’hôte intermédiaire ait été initialement postulé (une étude publiée en juillet 2020 a suggéré que les Pangolins sont un hôte intermédiaire des coronavirus de type SARS-CoV-2 ^{[98] [99]} ), les études ultérieures n’ont pas étayé leur contribution au débordement. ^[84] Les preuves contre cette hypothèse incluent le fait que les échantillons de virus du pangolin sont trop éloignés du SRAS-CoV-2 : les isolats obtenus à partir de Pangolins saisis dans le Guangdong n’étaient identiques qu’à 92 % en séquence avec le génome du SRAS-CoV-2 (correspondances supérieures à 90 peut sembler élevé, mais en termes génomiques, il s’agit d’un large écart évolutif ^[100] ). De plus, malgré des similitudes dans quelques acides aminés critiques, ^[101]les échantillons de virus pangolin présentent une faible liaison au récepteur ACE2 humain. ^[102]

Phylogénétique et taxonomie

Informations génomiques

Organisation génomique de l’isolat Wuhan-Hu-1, le premier échantillon séquencé de SARS-CoV-2
ID du génome NCBI	86693
Taille du génome	29 903 bases
Année d’achèvement	2020
Navigateur de génome ( UCSC )

Le SRAS‐CoV‐2 appartient à la grande famille des virus connus sous le nom de coronavirus . ^[27] Il s’agit d’un virus à ARN simple brin (+ssRNA) de sens positif, avec un seul segment d’ARN linéaire. Les coronavirus infectent les humains, d’autres mammifères, y compris le bétail et les animaux de compagnie, et les espèces aviaires. ^[103] Les coronavirus humains sont capables de provoquer des maladies allant du rhume à des maladies plus graves telles que le syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS, taux de mortalité d’environ 34 %). Le SRAS-CoV-2 est le septième coronavirus connu à infecter les humains, après 229E , NL63 , OC43 , HKU1 , MERS-CoV, et le SARS-CoV original . ^[104]

Comme le coronavirus lié au SRAS impliqué dans l’épidémie de SRAS de 2003, le SRAS‐CoV‐2 fait partie du sous-genre Sarbecovirus ( bêta-CoV lignée B). ^{[105] [106]} Les coronavirus subissent de fréquentes recombinaisons. ^[107] Le mécanisme de recombinaison dans les virus à ARN non segmentés tels que le SRAS-CoV-2 se fait généralement par réplication par choix de copie, dans laquelle le matériel génétique passe d’une molécule matrice d’ARN à une autre pendant la réplication. ^[108] La séquence d’ARN du SARS-CoV-2 a une longueur d’environ 30 000 bases , ^[109] relativement longue pour un coronavirus (qui à son tour porte les plus grands génomes parmi toutes les familles d’ARN) ^[110]Son génome se compose presque entièrement de séquences codant pour des protéines, un trait partagé avec d’autres coronavirus. ^[107]

Micrographie électronique à transmission de virions du SRAS‐CoV‐2 (rouge) isolés chez un patient pendant la pandémie de COVID-19

Une caractéristique distinctive du SRAS-CoV-2 est son incorporation d’un site polybasique clivé par la furine , ^[101] qui semble être un élément important renforçant sa virulence. ^[111] Il a été suggéré que l’acquisition du site de clivage de la furine dans la protéine S du SRAS-CoV-2 était essentielle pour le transfert zoonotique aux humains. ^[112] La furine protéase reconnaît la séquence peptidique canonique R X[ R / K ] R ↓X où le site de clivage est indiqué par une flèche vers le bas et X est n’importe quel acide aminé . ^{[113] [114]}Dans le SARS-CoV-2, le site de reconnaissance est formé par la séquence nucléotidique à 12 codons incorporée CCT CGG CGG GCA qui correspond à la séquence d’acides aminés P RR A . ^[115] Cette séquence est en amont d’une arginine et sérine qui forme le site de clivage S1/S2 ( P RR A R ↓ S ) de la protéine de pointe. ^[116] Bien que de tels sites soient une caractéristique naturelle commune d’autres virus de la sous-famille Orthocoronavirinae, ^[115] il apparaît dans quelques autres virus du genre Beta-CoV , ^[117] et il est unique parmi les membres de son sous-genre pour un tel site.^[101] Le site de clivage de la furine PRRAR↓ est identique à celui du coronavirus félin , une souche d’ alphacoronavirus 1 . ^[118]

Les données sur les séquences génétiques virales peuvent fournir des informations essentielles sur la probabilité que des virus séparés par le temps et l’espace soient épidémiologiquement liés. ^[119] Avec un nombre suffisant de génomes séquencés , il est possible de reconstruire un arbre phylogénétique de l’histoire des mutations d’une famille de virus. Au 12 janvier 2020, cinq génomes du SRAS‐CoV‐2 avaient été isolés à Wuhan et signalés par le Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies (CCDC) et d’autres institutions ; ^{[109] [120]} le nombre de génomes est passé à 42 au 30 janvier 2020. ^[121] Une analyse phylogénétique de ces échantillons a montré qu’ils étaient “étroitement liés avec au plus sept mutations par rapport à unancêtre commun », ce qui implique que la première infection humaine s’est produite en novembre ou décembre 2019. ^[121] L’examen de la topologie de l’arbre phylogénétique au début de la pandémie a également révélé de fortes similitudes entre les isolats humains. ^[122] Au 21 août 2021 , ^[update]3 422 génomes du SARS-CoV-2, appartenant à 19 souches, échantillonnés sur tous les continents sauf l’Antarctique étaient accessibles au public. ^[123]

Le 11 février 2020, le Comité international de taxonomie des virus a annoncé que, selon les règles existantes qui calculent les relations hiérarchiques entre les coronavirus sur la base de cinq séquences conservées d’acides nucléiques, les différences entre ce qui était alors appelé 2019-nCoV et le virus du SRAS de 2003 l’éclosion étaient insuffisantes pour en faire des espèces virales distinctes . Par conséquent, ils ont identifié le 2019-nCoV comme un virus du coronavirus lié au syndrome respiratoire aigu sévère . ^[124]

En juillet 2020, les scientifiques ont rapporté qu’une variante plus infectieuse du SRAS-CoV-2 avec la variante de protéine de pointe G614 a remplacé D614 comme forme dominante de la pandémie. ^{[125] [126]}

Les génomes et sous-génomes du coronavirus codent six cadres de lecture ouverts (ORF). ^[127] En octobre 2020, des chercheurs ont découvert un possible gène chevauchant nommé ORF3d , dans le génome du SRAS‐CoV‐2 . On ne sait pas si la protéine produite par ORF3d a une fonction, mais elle provoque une forte réponse immunitaire. ORF3d a déjà été identifié, dans une variante du coronavirus qui infecte les Pangolins . ^{[128] [129]}

Arbre phylogénétique

Un arbre phylogénétique basé sur des séquences du génome entier du SRAS-CoV-2 et des coronavirus apparentés est : ^{[130] [131]}

Coronavirus lié au SRAS‐CoV‐2

( Chauve -souris ) Rc-o319 , 81 % au SRAS-CoV-2, Rhinolophus cornutus , Iwate , Japon [132] Chauve -souris SL-ZXC21 , 88% au SARS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Zhoushan , Zhejiang [133] Bat SL-ZC45 , 88% au SRAS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Zhoushan, Zhejiang [133] Pangolin SARSr-CoV-GX, 85,3% au SARS-CoV-2, Manis javanica , passé en contrebande depuis l’Asie du Sud-Est [134] Pangolin SARSr-CoV-GD, 90,1% au SARS-CoV-2, Manis javanica , passé en contrebande depuis l’Asie du Sud-Est [135] Bat RshSTT182, 92,6 % au SRAS-CoV-2, Rhinolophus Shameli , Steung Treng , Cambodge [136] Bat RshSTT200, 92,6 % au SRAS-CoV-2, Rhinolophus Shameli , Steung Treng, Cambodge [136] (Chauve-souris) RacCS203 , 91,5 % au SRAS-CoV-2, Rhinolophus acuminatus , Chachoengsao , Thaïlande [131] (Chauve-souris) RmYN02 , 93,3 % au SARS-CoV-2, Rhinolophus malayanus , Mengla , Yunnan [137] (Chauve-souris) RpYN06 , 94,4 % au SRAS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Xishuangbanna , Yunnan [130] (Chauve-souris) RaTG13 , 96,1 % au SARS-CoV-2, Rhinolophus affinis , Mojiang , Yunnan [138] (Chauve-souris) BANAL-52 , 96,8 % au SARS-CoV-2, Rhinolophus malayanus , Vientiane , Laos [139] SRAS-CoV-2

SARS-CoV-1 , 79% au SARS-CoV-2

Variantes Micrographie électronique à transmission en fausses couleurs d’un coronavirus variant B.1.1.7. On pense que la transmissibilité accrue de la variante est due à des changements dans la structure des protéines de pointe, représentées ici en vert.

Il existe plusieurs milliers de variantes du SRAS-CoV-2, qui peuvent être regroupées en clades beaucoup plus grands . ^[140] Plusieurs nomenclatures de clades différentes ont été proposées. Nextstrain divise les variantes en cinq clades (19A, 19B, 20A, 20B et 20C), tandis que GISAID les divise en sept (L, O, V, S, G, GH et GR). ^[141]

Plusieurs variantes notables du SRAS-CoV-2 sont apparues fin 2020. L’ Organisation mondiale de la santé a actuellement déclaré cinq variantes préoccupantes , qui sont les suivantes : ^[142]

• Alpha : La lignée B.1.1.7 est apparue au Royaume-Uni en septembre 2020, avec des preuves d’une transmissibilité et d’une virulence accrues. Les mutations notables incluent N501Y et P681H .
  • Une mutation E484K dans certains virions de la lignée B.1.1.7 a été notée et est également suivie par diverses agences de santé publique .
• Bêta : La lignée B.1.351 est apparue en Afrique du Sud en mai 2020, avec des preuves d’une transmissibilité accrue et de modifications de l’antigénicité, certains responsables de la santé publique s’alarmant de son impact sur l’efficacité de certains vaccins. Les mutations notables incluent K417N , E484K et N501Y.
• Gamma : la lignée P.1 est apparue au Brésil en novembre 2020, également avec des preuves d’une transmissibilité et d’une virulence accrues, parallèlement à des modifications de l’antigénicité. Des préoccupations similaires concernant l’efficacité du vaccin ont été soulevées. Les mutations notables incluent également K417N, E484K et N501Y.
• Delta : la lignée B.1.617.2 est apparue en Inde en octobre 2020. Il existe également des preuves d’une transmissibilité accrue et de modifications de l’antigénicité.
• Omicron : la lignée B.1.1.529 est apparue au Botswana en novembre 2021.

D’autres variantes notables incluent 6 autres variantes désignées par l’OMS à l’ étude et le groupe 5 , qui a émergé parmi les visons au Danemark et a abouti à une campagne d’euthanasie des visons, le rendant pratiquement éteint. ^[143]

Virologie

Structure

Virion showing locations of structural proteins forming the viral envelope and the inner nucleocapsid” height=”169″ data-src=”//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e5/Coronavirus_virion_structure.svg/220px-Coronavirus_virion_structure.svg.png” width=”220″> Structure d’un Virion SARSr-CoV

Chaque Virion du SRAS-CoV-2 mesure 60 à 140 nanomètres (2,4 × 10 ⁻⁶ –5,5 × 10 ⁻⁶ po ) de diamètre ; ^{[104] [81]} sa masse au sein de la population humaine mondiale a été estimée entre 0,1 et 10 kilogrammes. ^[144] Comme les autres coronavirus, le SRAS-CoV-2 possède quatre protéines structurelles, connues sous le nom de protéines S ( pointe ), E ( enveloppe ), M ( membrane ) et N ( nucléocapside ) ; la protéine N contient le génome de l’ARN et les protéines S, E et M créent ensemble l’ enveloppe virale . ^[145]Les protéines du coronavirus S sont des glycoprotéines et également des protéines membranaires de type I (membranes contenant un seul domaine transmembranaire orienté du côté extracellulaire). ^[112] Ils sont divisés en deux parties fonctionnelles (S1 et S2). ^[103] Dans le SRAS-CoV-2, la protéine de pointe, qui a été imagée au niveau atomique à l’aide de la microscopie électronique cryogénique , ^{[146] [147]} est la protéine responsable de permettre au virus de se fixer et de fusionner avec la membrane de une cellule hôte; ^[145] spécifiquement, sa sous-unité S1 catalyse l’attachement, la fusion de la sous-unité S2. ^[148]

Homotrimère de pointe SARS‐CoV‐2 avec une sous-unité protéique mise en évidence. Le domaine de liaison ACE2 est magenta.

Génome

Au début de 2022, environ 7 millions de génomes du SRAS-CoV-2 avaient été séquencés et déposés dans des bases de données publiques et environ 800 000 autres environ étaient ajoutés chaque mois. ^[149]

Le SRAS-CoV-2 possède un génome d’ARN simple brin linéaire de sens positif d’environ 30 000 bases de long. ^[103] Son génome a un biais contre les nucléotides de cytosine (C) et de guanine (G) , comme les autres coronavirus. ^[150] Le génome a la composition la plus élevée en U (32,2 %), suivi de A (29,9 %), et une composition similaire de G (19,6 %) et C (18,3 %). ^[151] Le biais nucléotidique découle de la mutation des guanines et des cytosines en adénosines et uraciles , respectivement. ^[152] La mutation des dinucléotides CGest censé survenir pour éviter le mécanisme de défense des cellules lié à la protéine antivirale à doigt de zinc , ^[153] et pour réduire l’énergie nécessaire pour délier le génome pendant la réplication et la traduction ( paire de bases adénosine et uracile via deux liaisons hydrogène , cytosine et guanine via trois) . ^[152] L’épuisement des dinucléotides CG dans son génome a conduit le virus à avoir un biais notable d’utilisation des codons . Par exemple, les six codons différents de l’arginine ont une utilisation relative de codons synonymes d’AGA (2,67), CGU (1,46), AGG (.81), CGC (.58), CGA (.29) et CGG (.19). ^[151]Une tendance similaire au biais d’utilisation des codons est observée dans d’autres coronavirus liés au SRAS. ^[154]

Cycle de réplication

Les infections virales commencent lorsque les particules virales se lient aux récepteurs cellulaires de surface de l’hôte. ^[155] Des expériences de modélisation de protéines sur la protéine de pointe du virus ont rapidement suggéré que le SARS-CoV-2 avait une affinité suffisante pour le récepteur de l’ enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2) sur les cellules humaines pour les utiliser comme mécanisme d’ entrée cellulaire . ^[156] Le 22 janvier 2020, un groupe en Chine travaillant avec le génome complet du virus et un groupe aux États-Unis utilisant des méthodes de génétique inverse de manière indépendante et expérimentale ont démontré que l’ACE2 pouvait agir comme récepteur du SRAS‐CoV‐2. ^{[17] [157] [158] [159]}Des études ont montré que le SRAS-CoV-2 a une plus grande affinité pour l’ACE2 humain que le virus du SRAS d’origine. ^{[146] [160]} Le SRAS‐CoV‐2 peut également utiliser la basigine pour faciliter l’entrée dans les cellules. ^[161]

L’amorçage initial de la protéine de pointe par la protéase transmembranaire, la sérine 2 (TMPRSS2) est essentiel pour l’entrée du SRAS‐CoV‐2. ^[24] La protéine hôte neuropiline 1 (NRP1) peut aider le virus à entrer dans la cellule hôte en utilisant ACE2. ^[162] Après qu’un Virion du SRAS-CoV-2 se soit attaché à une cellule cible, le TMPRSS2 de la cellule ouvre la protéine de pointe du virus, exposant un peptide de fusion dans la sous-unité S2 et le récepteur hôte ACE2. ^[148] Après la fusion, un endosome se forme autour du Virion, le séparant du reste de la cellule hôte. Le Virion s’échappe lorsque le pH de l’endosome chute ou lorsque la cathepsine , une cystéine hôteprotéase, le clive. ^[148] Le Virion libère alors de l’ARN dans la cellule et force la cellule à produire et à diffuser des copies du virus , qui infectent davantage de cellules. ^[163]

Le SRAS‐CoV‐2 produit au moins trois facteurs de virulence qui favorisent l’excrétion de nouveaux virions des cellules hôtes et inhibent la réponse immunitaire . ^[145] La question de savoir s’ils incluent la régulation à la baisse de l’ACE2, comme on le voit dans des coronavirus similaires, reste à l’étude (en mai 2020). ^[164]

Micrographies électroniques à balayage colorisées numériquement de virions du SRAS-CoV-2 (jaunes) émergeant de cellules humaines cultivées en laboratoire

Traitement et développement de médicaments

Très peu de médicaments sont connus pour inhiber efficacement le SARS-CoV-2. Le masitinib est un médicament cliniquement sûr et il a récemment été découvert qu’il inhibait sa principale protéase , 3CLpro, et qu’il présentait une réduction de plus de 200 fois des titres viraux dans les poumons et le nez chez la souris. Cependant, il n’est pas approuvé pour le traitement du COVID-19 chez l’homme depuis août 2021. ^{[165] [ nécessite une mise à jour ]} En décembre 2021, les États-Unis ont accordé une autorisation d’utilisation d’urgence au nirmatrelvir/ritonavir pour le traitement du virus ; ^[166] Union européenne , Royaume-Uni et Canadaa emboîté le pas avec une autorisation complète peu de temps après. ^{[167] [168] [169]} Une étude a révélé que le nirmatrelvir/ritonavir réduisait le risque d’hospitalisation et de décès de 88 %. ^[170]

COVID Moonshot est un projet collaboratif international de science ouverte lancé en mars 2020 dans le but de développer un médicament antiviral oral non breveté pour le traitement du SRAS-CoV-2 . ^[171]

Épidémiologie

Les tests rétrospectifs collectés dans le cadre du système de surveillance chinois n’ont révélé aucune indication claire d’une circulation substantielle non reconnue du SRAS-CoV-2 à Wuhan au cours de la dernière partie de 2019. ^[84]

Une méta-analyse de novembre 2020 a estimé le nombre de reproduction de base ( R 0 {displaystyle R_{0}} ) du virus entre 2,39 et 3,44. ^[20] Cela signifie que chaque infection par le virus devrait entraîner 2,39 à 3,44 nouvelles infections lorsqu’aucun membre de la communauté n’est immunisé et qu’aucune mesure préventive n’est prise. Le nombre de reproduction peut être plus élevé dans des conditions densément peuplées telles que celles que l’on trouve sur les navires de croisière . ^[172] Le comportement humain affecte la valeur R0 et, par conséquent, les estimations de R0 diffèrent selon les pays, les cultures et les normes sociales. Par exemple, une étude a trouvé un R0 relativement faible (~3,5) en Suède, en Belgique et aux Pays-Bas, tandis que l’Espagne et les États-Unis avaient des valeurs de R0 significativement plus élevées (5,9 à 6,4, respectivement). ^[173]

Valeur reproductive R0 des variantes du SARS-Cov2

une variante	R0	la source
Souche de référence/ancestrale	~2,8	[174]
Alpha (B.1.1.7)	(40 à 90 % plus élevé que les variantes précédentes)	[175]
Delta (B.1.617.2)	~5 (3-8)	[176]

Il y a eu environ 96 000 cas confirmés d’infection en Chine continentale. ^[177] Alors que la proportion d’infections qui aboutissent à des cas confirmés ou à une évolution vers une maladie diagnostiquable reste incertaine, ^[178] un modèle mathématique a estimé que 75 815 personnes ont été infectées le 25 janvier 2020 à Wuhan seulement, à un moment où le nombre de cas confirmés dans le monde n’était que de 2 015. ^[179] Avant le 24 février 2020, plus de 95 % de tous les décès dus au COVID-19 dans le monde étaient survenus dans la province du Hubei , où se trouve Wuhan. ^{[180] [181]} Au 15 mai 2022, le pourcentage était tombé à 0,051 %. ^[177]

Au 15 mai 2022, il y avait eu 521 226 458 cas confirmés au total d’infection par le SRAS‐CoV‐2 dans le cadre de la pandémie en cours. ^[177] Le nombre total de décès attribués au virus est de 6 263 525. ^[177]

Voir également

• Protéase de type 3C (NS5)

Références

1. ^ Solodovnikov, Alexey; Arkhipova, Valeria (29 juillet 2021). “Достоверно красиво: как мы сделали 3D-модель SARS-CoV-2” [Vraiment magnifique : comment nous avons créé le modèle 3D du SARS-CoV-2] (en russe). N+1 . Archivé de l’original le 30 juillet 2021 . Récupéré le 30 juillet 2021 .
2. ^ ^{un groupe d’étude b} Coronaviridae du Comité international sur la taxonomie des virus (avril 2020). “L’espèce Coronavirus lié au syndrome respiratoire aigu sévère : classer le 2019-nCoV et le nommer SARS-CoV-2” . Microbiologie naturelle . 5 (4): 536–544. doi : 10.1038/s41564-020-0695-z . PMC 7095448 . PMID 32123347 .
3. ^ Zimmer C (26 février 2021). “La vie secrète d’un coronavirus – Une bulle de gènes huileuse de 100 nanomètres de large a tué plus de deux millions de personnes et remodelé le monde. Les scientifiques ne savent pas trop quoi en penser” . Archivé de l’original le 27 février 2021 . Récupéré le 28 février 2021 .
4. ^ Définitions des cas de surveillance pour l’infection humaine par le nouveau coronavirus (nCoV) : directives provisoires v1, janvier 2020 (rapport). Organisation mondiale de la santé. Janvier 2020. hdl : 10665/330376 . OMS/2019-nCoV/Surveillance/v2020.1.
5. ^ ^{un b} “les Professionnels de Santé : les Questions et les Réponses Fréquemment Posées” . Centres américains de contrôle et de prévention des maladies (CDC) . 11 février 2020. Archivé de l’original le 14 février 2020 . Récupéré le 15 février 2020 .
6. ^ “À propos du nouveau coronavirus (2019-nCoV)” . Centres américains de contrôle et de prévention des maladies (CDC) . 11 février 2020. Archivé de l’original le 11 février 2020 . Récupéré le 25 février 2020 .
7. ^ Harmon A (4 mars 2020). « Nous avons parlé à six Américains atteints du coronavirus » . Le New York Times . Archivé de l’original le 13 mars 2020 . Récupéré le 16 mars 2020 .
8. ^ ^{un b} Wong G, Bi YH, Wang QH, Chen XW, Zhang ZG, Yao YG (mai 2020). “Origines zoonotiques du coronavirus humain 2019 (HCoV-19 / SARS-CoV-2) : pourquoi ce travail est-il important ?” . Recherche zoologique . 41 (3): 213-219. doi : 10.24272/j.issn.2095-8137.2020.031 . PMC 7231470 . PMID 32314559 .
9. ^ ^{un bcde Andersen KG , Rambaut} A, Lipkin WI, Holmes EC, Garry RF (avril 2020). “L’origine proximale du SRAS-CoV-2” . Médecine naturelle . 26 (4): 450–452. doi : 10.1038/s41591-020-0820-9 . PMC 7095063 . PMID 32284615 .
10. ^ ^{un bc van Doremalen} N, Bushmaker T, Morris DH, Holbrook MG, Gamble A, Williamson BN, et al. (Avril 2020). “Stabilité des aérosols et de la surface du SARS-CoV-2 par rapport au SARS-CoV-1” . Le New England Journal of Medicine . 382 (16): 1564-1567. doi : 10.1056/NEJMc2004973 . PMC 7121658 . PMID 32182409 .
11. ^ “Base de données hCoV-19” . Banque nationale de gènes de Chine. Archivé de l’original le 17 juin 2020 . Récupéré le 2 juin 2020 .
12. ^ “Déclaration sur la deuxième réunion du Comité d’urgence du Règlement sanitaire international (2005) concernant l’épidémie de nouveau coronavirus (2019-nCoV)” . Organisation mondiale de la santé (OMS) (Communiqué de presse). 30 janvier 2020. Archivé de l’original le 31 janvier 2020 . Récupéré le 30 janvier 2020 .
13. ^ “Remarques d’ouverture du directeur général de l’OMS lors de la conférence de presse sur COVID-19 – 11 mars 2020” . Organisation mondiale de la santé (OMS) (Communiqué de presse). 11 mars 2020. Archivé de l’original le 11 mars 2020 . Récupéré le 12 mars 2020 .
14. ^ Machhi J, Herskovitz J, Senan AM, Dutta D, Nath B, Oleynikov MD, et al. (septembre 2020). “L’histoire naturelle, la pathobiologie et les manifestations cliniques des infections par le SRAS-CoV-2” . Journal de pharmacologie neuroimmune . 15 (3): 359–386. doi : 10.1007/s11481-020-09944-5 . PMC 7373339 . PMID 32696264 .
15. ^ ^{un b} Chan JF, Yuan S, Kok KH, To KK, Chu H, Yang J, et al. (février 2020). “Un cluster familial de pneumonie associé au nouveau coronavirus 2019 indiquant une transmission de personne à personne : une étude d’un cluster familial” . Lancette . 395 (10223): 514-523. doi : 10.1016/S0140-6736(20)30154-9 . PMC 7159286 . PMID 31986261 .
16. ^ “Nouveau coronavirus stable pendant des heures sur les surfaces” . Instituts nationaux de la santé (NIH) . NIH.gov. 17 mars 2020. Archivé de l’original le 23 mars 2020 . Récupéré le 4 mai 2020 .
17. ^ ^{un bcd Zhou P} , Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. (mars 2020). “Une épidémie de pneumonie associée à un nouveau coronavirus d’origine probable de chauve-souris” . Nature . 579 (7798): 270–273. Bibcode : 2020Natur.579..270Z . doi : 10.1038/s41586-020-2012-7 . PMC 7095418 . PMID 32015507 .
18. ^ Nouveau coronavirus (2019-nCoV) : rapport de situation, 22 (Rapport). Organisation mondiale de la santé . 11 février 2020. hdl : 10665/330991 .
19. ^ ^{un bc Cohen} J (janvier 2020). “Le marché des fruits de mer de Wuhan n’est peut-être pas la source d’un nouveau virus se propageant dans le monde”. Sciences . doi : 10.1126/science.abb0611 . S2CID 214574620 .
20. ^ ^{un b} Billah MA, Miah MM, Khan MN (11 novembre 2020). “Nombre reproductif de coronavirus : une revue systématique et une méta-analyse basée sur des preuves au niveau mondial” . PLOS ONE . 15 (11) : e0242128. Bibcode : 2020PLoSO..1542128B . doi : 10.1371/journal.pone.0242128 . PMC 7657547 . PMID 33175914 .
21. ^ “Variantes COVID-19 : quel est le problème ?” . Clinique Mayo .
22. ^ « Comment le coronavirus se propage Archivé le 3 avril 2020 à la Wayback Machine », Centers for Disease Control and Prevention, récupéré le 14 mai 2021.
23. ^ ” Maladie à coronavirus (COVID-19): Comment se transmet-elle? Archivé le 15 octobre 2020 à la Wayback Machine “, Organisation mondiale de la santé
24. ^ ^{un b} Hoffmann M, Kleine-Weber H, Schroeder S, Krüger N, Herrler T, Erichsen S, et al. (Avril 2020). “L’entrée des cellules du SRAS-CoV-2 dépend de l’ACE2 et du TMPRSS2 et est bloquée par un inhibiteur de protéase cliniquement prouvé” . Cellule . 181 (2) : 271–280.e8. doi : 10.1016/j.cell.2020.02.052 . PMC 7102627 . PMID 32142651 .
25. ^ Zhao P, Praissman JL, Grant OC, Cai Y, Xiao T, Rosenbalm KE, et al. (Octobre 2020). “Interactions virus-récepteur du pic SARS-CoV-2 glycosylé et du récepteur ACE2 humain” . Cellule Hôte & Microbe . 28 (4) : 586–601.e6. doi : 10.1016/j.chom.2020.08.004 . PMC 7443692 . PMID 32841605 .
26. ^ Huang P (22 janvier 2020). “Comment le coronavirus de Wuhan se compare-t-il au MERS, au SRAS et au rhume ?” . NPR . Archivé de l’original le 2 février 2020 . Récupéré le 3 février 2020 .
27. ^ ^{un b} Fox D (janvier 2020). “Ce que vous devez savoir sur le nouveau coronavirus”. Nature . doi : 10.1038/d41586-020-00209-y . PMID 33483684 . S2CID 213064026 .
28. ^ Organisation mondiale de la santé (30 janvier 2020). Nouveau coronavirus (2019-nCoV) : état des lieux, 10 (Rapport). Organisation mondiale de la santé . hdl : 10665/330775 .
29. ^ “Meilleures pratiques de l’Organisation mondiale de la santé pour la dénomination des nouvelles maladies infectieuses humaines” (PDF) . QUI . Mai 2015. Archivé (PDF) de l’original le 12 février 2020.
30. ^ “Novel coronavirus nommé ‘Covid-19’: QUI” . AUJOURD’HUI en ligne. Archivé de l’original le 21 mars 2020 . Récupéré le 11 février 2020 .
31. ^ “Le coronavirus propage le racisme contre et parmi les Chinois de souche” . L’Économiste . 17 février 2020. Archivé de l’original le 17 février 2020 . Récupéré le 17 février 2020 .
32. ^ “Nommer la maladie à coronavirus (COVID-2019) et le virus qui la cause” . Organisation mondiale de la santé. Archivé de l’original le 28 février 2020 . Récupéré le 14 décembre 2020 . ICTV a annoncé le « coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) » comme nom du nouveau virus le 11 février 2020. Ce nom a été choisi parce que le virus est génétiquement lié au coronavirus responsable de l’épidémie de SRAS de 2003. Bien que liés, les deux virus sont différents.
33. ^ Hui M (18 mars 2020). “Pourquoi l’OMS n’appelle-t-elle pas le coronavirus par son nom, SARS-CoV-2 ?” . Quartz . Archivé de l’original le 25 mars 2020 . Récupéré le 26 mars 2020 .
34. ^ “Nommer la maladie à coronavirus (COVID-2019) et le virus qui la cause” . Organisation mondiale de la santé. Archivé de l’original le 28 février 2020 . Récupéré le 14 décembre 2020 . Du point de vue de la communication des risques, l’utilisation du nom de SRAS peut avoir des conséquences imprévues en créant une peur inutile pour certaines populations. … Pour cette raison et d’autres, l’OMS a commencé à désigner le virus comme “le virus responsable du COVID-19” ou “le virus COVID-19” lorsqu’il communique avec le public. Aucune de ces désignations n’est [ sic ] destinée à remplacer le nom officiel du virus tel qu’accepté par l’ICTV.
35. ^ https://www.nea.org/advocating-for-change/new-from-nea/hate-and-bias-covid-19 “C’est raciste et ça crée de la xénophobie”, professeur d’études asiatiques américaines à l’Université de Californie à Berkeley Harvey Dong a déclaré au Washington Post. “C’est une situation très dangereuse.”
36. ^ https://thehill.com/homenews/administration/488479-who-official-warns-against-calling-it-chinese-virus-says-there-is-no?rl=1 Ryan n’est pas le premier responsable de l’OMS à repousser la phrase. Le directeur général Tedros Adhanom Ghebreyesus a déclaré plus tôt ce mois-ci que le terme est « douloureux à voir » et « plus dangereux que le virus lui-même ».
37. ^ Gover AR, Harper SB, Langton L (juillet 2020). “Crime de haine anti-asiatique pendant la pandémie de COVID-19 : Exploration de la reproduction des inégalités” . Journal américain de justice pénale . 45 (4): 647–667. doi : 10.1007/s12103-020-09545-1 . PMC 7364747 . PMID 32837171 .
38. ^ Li JY, You Z, Wang Q, Zhou ZJ, Qiu Y, Luo R, Ge XY (mars 2020). “L’épidémie de pneumonie à nouveau coronavirus 2019 (2019-nCoV) et les perspectives des maladies infectieuses émergentes à l’avenir” . Microbes et Infection . 22 (2): 80–85. doi : 10.1016/j.micinf.2020.02.002 . PMC 7079563 . PMID 32087334 .
39. ^ Kessler G (17 avril 2020). “La fausse affirmation de Trump selon laquelle l’OMS a déclaré que le coronavirus n’était” pas transmissible ” ” . The Washington Post . Archivé de l’original le 17 avril 2020 . Récupéré le 17 avril 2020 .
40. ^ Kuo L (21 janvier 2020). “La Chine confirme la transmission interhumaine du coronavirus” . Le Gardien . Archivé de l’original le 22 mars 2020 . Récupéré le 18 avril 2020 .
41. ^ “Comment COVID-19 se propage” . Centres américains de contrôle et de prévention des maladies (CDC) . 27 janvier 2020. Archivé de l’original le 28 janvier 2020 . Récupéré le 29 janvier 2020 .
42. ^ Edwards E (25 janvier 2020). « Comment le coronavirus se propage-t-il ? » . Nouvelles NBC . Archivé de l’original le 28 janvier 2020 . Récupéré le 13 mars 2020 .
43. ^ Anfinrud P, Stadnytskyi V, Bax CE, Bax A (mai 2020). “Visualisation des gouttelettes de fluide oral générées par la parole avec diffusion de la lumière laser” . Le New England Journal of Medicine . 382 (21): 2061-2063. doi : 10.1056/NEJMc2007800 . PMC 7179962 . PMID 32294341 .
44. ^ Stadnytskyi V, Bax CE, Bax A, Anfinrud P (juin 2020). “La durée de vie dans l’air des petites gouttelettes de parole et leur importance potentielle dans la transmission du SRAS-CoV-2” . Actes de l’Académie nationale des sciences des États-Unis d’Amérique . 117 (22): 11875–11877. doi : 10.1073/pnas.2006874117 . PMC 7275719 . PMID 32404416 .
45. ^ Klompas M, Baker MA, Rhee C (août 2020). “Transmission aérienne du SRAS-CoV-2 : considérations théoriques et preuves disponibles” . JAMA . 324 (5): 441–442. doi : 10.1001/jama.2020.12458 . PMID 32749495 . S2CID 220500293 . Les enquêteurs ont démontré que parler et tousser produisent un mélange de gouttelettes et d’aérosols de différentes tailles, que ces sécrétions peuvent voyager ensemble jusqu’à 27 pieds, qu’il est possible que le SRAS-CoV-2 reste en suspension dans l’air et viable pendant des heures, que l’ARN du SRAS-CoV-2 peut être récupéré à partir d’échantillons d’air dans les hôpitaux et qu’une mauvaise ventilation prolonge la durée pendant laquelle les aérosols restent en suspension dans l’air.
46. ^ Rettner R (21 janvier 2021). “Parler est pire que tousser pour propager le COVID-19 à l’intérieur” . livescience.com . Récupéré le 23 janvier 2021 . Dans un scénario modélisé, les chercheurs ont découvert qu’après une courte toux, le nombre de particules infectieuses dans l’air chuterait rapidement après 1 à 7 minutes ; en revanche, après avoir parlé pendant 30 secondes, ce n’est qu’après 30 minutes que le nombre de particules infectieuses tomberait à des niveaux similaires ; et un grand nombre de particules étaient encore en suspension après une heure. En d’autres termes, une dose de particules virales capables de provoquer une infection persisterait dans l’air beaucoup plus longtemps après la parole qu’une toux. (Dans ce scénario modélisé, le même nombre de gouttelettes a été admis pendant une toux de 0,5 seconde que pendant 30 secondes de parole.)
47. ^ de Oliveira PM, Mesquita LC, Gkantonas S, Giusti A, Mastorakos E (janvier 2021). « Évolution des pulvérisations et des aérosols à partir des rejets respiratoires : estimations théoriques pour mieux comprendre la transmission virale » . Actes de la Royal Society A: Sciences mathématiques, physiques et d’ingénierie . 477 (2245) : 20200584. Bibcode : 2021RSPSA.47700584D . doi : 10.1098/rspa.2020.0584 . PMC 7897643 . PMID 33633490 . S2CID 231643585 .
48. ^ Mandavilli A (4 juillet 2020). “239 experts avec une seule grande revendication : le coronavirus est en suspension dans l’air – L’OMS a résisté aux preuves croissantes que les particules virales flottant à l’intérieur sont infectieuses, disent certains scientifiques. L’agence maintient que la recherche n’est toujours pas concluante” . Le New York Times . Archivé de l’original le 17 novembre 2020 . Récupéré le 5 juillet 2020 .
49. ^ Tufekci Z (30 juillet 2020). “Nous devons parler de ventilation” . L’Atlantique . Archivé de l’original le 17 novembre 2020 . Récupéré le 8 septembre 2020 .
50. ^ Lewis D (juillet 2020). “Des preuves de plus en plus nombreuses suggèrent que le coronavirus est en suspension dans l’air – mais les conseils de santé n’ont pas rattrapé” . Nature . 583 (7817): 510–513. Bibcode : 2020Natur.583..510L . doi : 10.1038/d41586-020-02058-1 . PMID 32647382 . S2CID 220470431 .
51. ^ Popa A, Genger JW, Nicholson MD, Penz T, Schmid D, Aberle SW, et al. (Décembre 2020). “L’épidémiologie génomique des événements de super-propagation en Autriche révèle la dynamique mutationnelle et les propriétés de transmission du SRAS-CoV-2” . Science médecine translationnelle . 12 (573) : eabe2555. doi : 10.1126/scitranslmed.abe2555 . PMC 7857414 . PMID 33229462 .
52. ^ He X, Lau EH, Wu P, Deng X, Wang J, Hao X, et al. (Mai 2020). “Dynamique temporelle dans l’excrétion virale et la transmissibilité de COVID-19” . Médecine naturelle . 26 (5): 672–675. doi : 10.1021/acs.chas.0c00035 . PMC 7216769 . PMID 32296168 .
53. ^ Watanabe T, Bartrand TA, Weir MH, Omura T, Haas CN (juillet 2010). “Développement d’un modèle dose-réponse pour le coronavirus du SRAS” . Analyse des risques . 30 (7): 1129–138. doi : 10.1111/j.1539-6924.2010.01427.x . PMC 7169223 . PMID 20497390 .
54. ^ Artika IM, Ma’roef CN (mai 2017). “Biosécurité en laboratoire pour la manipulation des virus émergents” . Journal Asie-Pacifique de biomédecine tropicale . 7 (5): 483–491. doi : 10.1016/j.apjtb.2017.01.020 . PMC 7103938 . PMID 32289025 .
55. ^ “Préparer votre lieu de travail pour COVID-19” (PDF) . Organisation mondiale de la santé . 27 février 2020. Archivé (PDF) de l’original le 2 mars 2020 . Récupéré le 3 mars 2020 .
56. ^ Yong E (20 mars 2020). « Pourquoi le coronavirus a-t-il eu autant de succès ? » . L’Atlantique . Archivé de l’original le 20 mars 2020 . Récupéré le 20 mars 2020 .
57. ^ Gibbens S (18 mars 2020). “Pourquoi le savon est préférable à l’eau de Javel dans la lutte contre le coronavirus” . National géographique . Archivé de l’original le 2 avril 2020 . Récupéré le 2 avril 2020 .
58. ^ Holshue ML, DeBolt C, Lindquist S, Lofy KH, Wiesman J, Bruce H, et al. (mars 2020). “Premier cas de nouveau coronavirus 2019 aux États-Unis” . Le New England Journal of Medicine . 382 (10): 929–936. doi : 10.1056/NEJMoa2001191 . PMC 7092802 . PMID 32004427 .
59. ^ Li D, Jin M, Bao P, Zhao W, Zhang S (mai 2020). “Caractéristiques cliniques et résultats des tests de sperme chez les hommes atteints de la maladie à coronavirus 2019” . Réseau JAMA Ouvert . 3 (5) : e208292. doi : 10.1001/jamanetworkopen.2020.8292 . PMC 7206502 . PMID 32379329 .
60. ^ Wölfel R, Corman VM, Guggemos W, Seilmaier M, Zange S, Müller MA, et al. (Mai 2020). “Évaluation virologique des patients hospitalisés atteints de COVID-2019” . Nature . 581 (7809): 465–469. Bibcode : 2020Natur.581..465W . doi : 10.1038/s41586-020-2196-x . PMID 32235945 .
61. ^ Kupferschmidt K (février 2020). “L’étude affirmant que le nouveau coronavirus peut être transmis par des personnes sans symptômes était erronée”. Sciences . doi : 10.1126/science.abb1524 . S2CID 214094598 .
62. ^ À KK, Tsang OT, Leung WS, Tam AR, Wu TC, Lung DC, et al. (Mai 2020). “Profils temporels de la charge virale dans les échantillons de salive oropharyngés postérieurs et les réponses des anticorps sériques lors de l’infection par le SRAS-CoV-2 : une étude de cohorte observationnelle” . Le Lancet. Maladies infectieuses . 20 (5): 565–574. doi : 10.1016/S1473-3099(20)30196-1 . PMC 7158907 . PMID 32213337 .
63. ^ Avanzato VA, Matson MJ, Seifert SN, Pryce R, Williamson BN, Anzick SL, et al. (Décembre 2020). “Étude de cas : Excrétion infectieuse prolongée du SRAS-CoV-2 chez un individu immunodéprimé asymptomatique atteint d’un cancer” . Cellule . 183 (7): 1901–1912.e9. doi : 10.1016/j.cell.2020.10.049 . PMC 7640888 . PMID 33248470 .
64. ^ ^{a b} Hou YJ, Okuda K, Edwards CE, Martinez DR, Asakura T, Dinnon KH, et al. (juillet 2020). “La génétique inverse du SRAS-CoV-2 révèle un gradient d’infection variable dans les voies respiratoires” . Cellule . 182 (2) : 429–446.e14. doi : 10.1016/j.cell.2020.05.042 . PMC 7250779 . PMID 32526206 .
65. ^ Banerjee A, Mossman K, Baker ML (février 2021). “Potentiel zooanthroponotique du SRAS-CoV-2 et implications de la réintroduction dans les populations humaines” . Cellule Hôte & Microbe . 29 (2): 160–164. doi : 10.1016/j.chom.2021.01.004 . PMC 7837285 . PMID 33539765 .
66. ^ “Questions et réponses sur le COVID-19: OIE – Organisation mondiale de la santé animale” . www.oie.int . Archivé de l’original le 31 mars 2020 . Récupéré le 16 avril 2020 .
67. ^ Goldstein J (6 avril 2020). “Le tigre du zoo du Bronx est malade du coronavirus” . Le New York Times . Archivé de l’original le 9 avril 2020 . Récupéré le 10 avril 2020 .
68. ^ “Déclaration de l’USDA sur la confirmation de COVID-19 dans un tigre à New York” . Département de l’agriculture des États-Unis . 5 avril 2020. Archivé de l’original le 15 avril 2020 . Récupéré le 16 avril 2020 .
69. ^ “Si vous avez des animaux – Maladie à coronavirus 2019 (COVID-19)” . Centres de contrôle et de prévention des maladies (CDC) . 13 avril 2020. Archivé de l’original le 1er avril 2020 . Récupéré le 16 avril 2020 .
70. ^ Organisation mondiale de la santé (1er février 2020). Nouveau coronavirus (2019-nCoV) : état des lieux, 12 (Rapport). Organisation mondiale de la santé . hdl : 10665/330777 .
71. ^ Nogrady B (novembre 2020). “Ce que disent les données sur les infections COVID asymptomatiques” . Nature . 587 (7835): 534–535. Bibcode : 2020Natur.587..534N . doi : 10.1038/d41586-020-03141-3 . PMID 33214725 .
72. ^ Li R, Pei S, Chen B, Song Y, Zhang T, Yang W, Shaman J (mai 2020). “Une infection substantielle non documentée facilite la diffusion rapide du nouveau coronavirus (SARS-CoV-2)” . Sciences . 368 (6490): 489–493. Bib code : 2020Sci …368..489L . doi : 10.1126/science.abb3221 . PMC 7164387 . PMID 32179701 .
73. ↑ Daily Telegraph , jeudi 28 mai 2020, page 2 colonne 1, qui fait référence à la revue médicale Thorax ; Thorax Article de mai 2020 COVID-19 : sur les traces d’Ernest Shackleton Archivé le 30 mai 2020 sur la Wayback Machine
74. ^ He X, Lau EH, Wu P, Deng X, Wang J, Hao X, et al. (Mai 2020). “Dynamique temporelle dans l’excrétion virale et la transmissibilité de COVID-19” . Médecine naturelle . 26 (5): 672–675. doi : 10.1038/s41591-020-0869-5 . PMID 32296168 .
75. ^ Lui, Xi; Lau, Eric HY; Wu, Peng; Deng, Xilong ; Wang, Jian; Hao, Xinxin ; Lau, Yiu Chung; Wong, Jessica Y.; Guan, Yujuan ; Tan, Xinghua ; Mo, Xiaoneng ; Chen, Yanqing; Liao, Baolin ; Chen, Weilie; Hu, Fengyu ; Zhang, Qing; Zhong, Mingqiu; Wu, Yanrong ; Zhao, Lingzhai ; Zhang, Fuchun ; Cowling, Benjamin J.; Li, croc ; Leung, Gabriel M. (septembre 2020). “Correction d’auteur : Dynamique temporelle dans l’excrétion virale et la transmissibilité de COVID-19” . Médecine naturelle . 26 (9) : 1491-1493. doi : 10.1038/s41591-020-1016-z . PMC 7413015 . PMID 32770170 .
76. ^ ^{un b} Ledford H (septembre 2020). « Réinfections à coronavirus : trois questions que se posent les scientifiques » . Nature . 585 (7824): 168–169. doi : 10.1038/d41586-020-02506-y . PMID 32887957 . S2CID 221501940 .
77. ^ ^{a b} To KK, Hung IF, Ip JD, Chu AW, Chan WM, Tam AR, et al. (août 2020). « Réinfection au COVID-19 par une souche de SARS-coronavirus-2 phylogénétiquement distincte confirmée par séquençage du génome entier » . Maladies infectieuses cliniques . 73 (9) : e2946–e2951. doi : 10.1093/cid/ciaa1275 . PMC 7499500 . PMID 32840608 . S2CID 221308584 .
78. ^ ^{un b} Tillett RL, Sevinsky JR, Hartley PD, Kerwin H, Crawford N, Gorzalski A, et al. (janvier 2021). “Évidence génomique pour la réinfection avec SARS-CoV-2 : une étude de cas” . Le Lancet. Maladies infectieuses . 21 (1): 52–58. doi : 10.1016/S1473-3099(20)30764-7 . PMC 7550103 . PMID 33058797 .
79. ^ Eschner K (28 janvier 2020). “Nous ne savons toujours pas d’où vient vraiment le coronavirus de Wuhan” . Sciences populaires . Archivé de l’original le 30 janvier 2020 . Récupéré le 30 janvier 2020 .
80. ^ Huang C, Wang Y, Li X, Ren L, Zhao J, Hu Y, et al. (février 2020). “Caractéristiques cliniques des patients infectés par le nouveau coronavirus 2019 à Wuhan, en Chine” . Lancette . 395 (10223): 497–506. doi : 10.1016/S0140-6736(20)30183-5 . PMC 7159299 . PMID 31986264 .
81. ^ ^{un b} Chen N, Zhou M, Dong X, Qu J, Gong F, Han Y, et al. (février 2020). “Caractéristiques épidémiologiques et cliniques de 99 cas de pneumonie à nouveau coronavirus de 2019 à Wuhan, Chine : une étude descriptive” . Lancette . 395 (10223): 507–513. doi : 10.1016/S0140-6736(20)30211-7 . PMC 7135076 . PMID 32007143 .
82. ^ ^{un b} Cyranoski D (mars 2020). “Le mystère s’approfondit sur la source animale du coronavirus” . Nature . 579 (7797): 18–19. Bibcode : 2020Natur.579…18C . doi : 10.1038/d41586-020-00548-w . PMID 32127703 .
83. ^ Yu WB, Tang GD, Zhang L, Corlett RT (mai 2020). “Décoder l’évolution et les transmissions du nouveau coronavirus de la pneumonie (SARS-CoV-2 / HCoV-19) à l’aide de données génomiques complètes” . Recherche zoologique . 41 (3): 247–257. doi : 10.24272/j.issn.2095-8137.2020.022 . PMC 7231477 . PMID 32351056 .
84. ^ ^{a b c d e} Rapport de la mission conjointe OMS-Chine sur la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) (PDF) (Rapport). Organisation mondiale de la santé (OMS). 24 février 2020. Archivé (PDF) de l’original le 29 février 2020 . Récupéré le 5 mars 2020 .
85. ^ Worobey M (décembre 2021). “Disséquer les premiers cas de COVID-19 à Wuhan”. Sciences . 374 (6572): 1202–1204. Bibcode : 2021Sci…374.1202W . doi : 10.1126/science.abm4454 . PMID 34793199 . S2CID 244403410 .
86. ^ Kang L, He G, Sharp AK, Wang X, Brown AM, Michalak P, Weger-Lucarelli J (août 2021). “Un balayage sélectif du gène Spike a entraîné l’adaptation humaine du SRAS-CoV-2” . Cellule . 184 (17): 4392–4400.e4. doi : 10.1016/j.cell.2021.07.007 . PMC 8260498 . PMID 34289344 .
87. ^ Decaro N, Lorusso A (mai 2020). “Nouveau coronavirus humain (SARS-CoV-2) : Une leçon tirée des coronavirus animaux” . Microbiologie vétérinaire . 244 : 108693. doi : 10.1016/j.vetmic.2020.108693 . PMC 7195271 . PMID 32402329 .
88. ^ Robson F, Khan KS, Le TK, Paris C, Demirbag S, Barfuss P, et al. (août 2020). “Coronavirus RNA Proofreading: Molecular Basis and Therapeutic Targeting [la correction publiée apparaît dans Mol Cell. 2020 Dec 17;80(6):1136-1138]” . Cellule moléculaire . 79 (5): 710–727. doi : 10.1016/j.molcel.2020.07.027 . PMC 7402271 . PMID 32853546 .
89. ^ Tao K, Tzou PL, Nouhin J, Gupta RK, de Oliveira T, Kosakovsky Pond SL, et al. (décembre 2021). “La signification biologique et clinique des variantes émergentes du SRAS-CoV-2” . Revues naturelles. Génétique . 22 (12): 757–773. doi : 10.1038/s41576-021-00408-x . PMC 8447121 . PMID 34535792 .
90. ^ Temmam, Sarah; Vongphayloth, Khamsing ; Salazar, Eduard Baquero; Munier, Sandie; Bonomi, Max; Regnault, Béatrice; Douangboubpha, Bounsavane; Karami, Yasaman; Chrétien, Delphine; Sanamxay, Daosavanh ; Xayaphet, Vilakhan (février 2022). “Coronavirus de chauve-souris apparentés au SARS-CoV-2 et infectieux pour les cellules humaines” . Nature .
91. ^ Mallapaty, Smriti (24 septembre 2021). “Les plus proches parents connus du virus à l’origine du COVID-19 trouvés au Laos” . Nature . 597 (7878): 603–603. doi : 10.1038/d41586-021-02596-2 .
92. ^ “Les virus de chauve-souris nouvellement découverts donnent des indices sur les origines de Covid” . New York Times . 14 octobre 2021.
93. ^ “Isolat de coronavirus de chauve-souris RaTG13, génome complet” . Centre national d’information sur la biotechnologie (NCBI) . 10 février 2020. Archivé de l’original le 15 mai 2020 . Récupéré le 5 mars 2020 .
94. ^ “Le ‘Argument du rasoir d’Occam’ n’a pas changé en faveur d’une fuite de laboratoire” . Snopes.com . Snopes . Récupéré le 18 juillet 2021 .
95. ^ Lu R, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, Wu H, et al. (février 2020). “Caractérisation génomique et épidémiologie du nouveau coronavirus 2019 : implications pour les origines du virus et la liaison aux récepteurs” . Lancette . 395 (10224): 565–574. doi : 10.1016/S0140-6736(20)30251-8 . PMC 7159086 . PMID 32007145 .
96. ^ O’Keeffe J, Freeman S, Nicol A (21 mars 2021). Les bases de la transmission du SRAS-CoV-2 . Vancouver, C.-B. : Centre de collaboration nationale en santé environnementale (NCCEH). ISBN 978-1-988234-54-0. Archivé de l’original le 12 mai 2021 . Récupéré le 12 mai 2021 .
97. ^ Holmes CE, Goldstein SA, Rasmussen AL, Robertson DL, Crits-Christoph A, Wertheim JO, et al. (août 2021). « Les origines du SARS-CoV-2 : un examen critique » . Cellule . 184 (19): 4848–4856. doi : 10.1016/j.cell.2021.08.017 . PMC 8373617 . PMID 34480864 .
98. ^ Xiao K, Zhai J, Feng Y, Zhou N, Zhang X, Zou JJ, et al. (juillet 2020). “Isolement du coronavirus lié au SRAS-CoV-2 des Pangolins malais” . Nature . 583 (7815): 286–289. Bibcode : 2020Natur.583..286X . doi : 10.1038/s41586-020-2313-x . PMID 32380510 . S2CID 218557880 .
99. ^ Zhao J, Cui W, Tian BP (2020). “Les hôtes intermédiaires potentiels pour le SARS-CoV-2” . Frontières en microbiologie . 11 : 580137. doi : 10.3389/fmicb.2020.580137 . PMC 7554366 . PMID 33101254 .
100. ^ “Pourquoi il est si difficile de retracer l’origine de COVID-19” . Sciences . National géographique. 10 septembre 2021.
101. ^ ^{un bc Hu} B, Guo H, Zhou P, Shi ZL (mars 2021). “Caractéristiques de SARS-CoV-2 et COVID-19” . Revues naturelles. Microbiologie . 19 (3): 141–154. doi : 10.1038/s41579-020-00459-7 . PMC 7537588 . PMID 33024307 .
102. ^ Giovanetti M, Benedetti F, Campisi G, Ciccozzi A, Fabris S, Ceccarelli G, et al. (janvier 2021). « Modèles d’évolution de SARS-CoV-2 : Instantané sur ses variantes de génome » . Communications sur la recherche biochimique et biophysique . 538 : 88–91. doi : 10.1016/j.bbrc.2020.10.102 . PMC 7836704 . PMID 33199021 . S2CID 226988090 .
103. ^ ^{un bc V’kovski} P, Kratzel A, Steiner S, Stalder H, Thiel V (mars 2021). “Biologie et réplication du coronavirus : implications pour le SRAS-CoV-2” . Revues naturelles. Microbiologie . 19 (3): 155–170. doi : 10.1038/s41579-020-00468-6 . PMC 7592455 . PMID 33116300 .
104. ^ ^{un b} Zhu N, Zhang D, Wang W, Li X, Yang B, Song J, et al. (février 2020). “Un nouveau coronavirus de patients atteints de pneumonie en Chine, 2019” . Le New England Journal of Medicine . 382 (8): 727–733. doi : 10.1056/NEJMoa2001017 . PMC 7092803 . PMID 31978945 .
105. ^ “Phylogénie des bêtacoronavirus de type SRAS” . prochaine souche . Archivé de l’original le 20 janvier 2020 . Récupéré le 18 janvier 2020 .
106. ^ Wong AC, Li X, Lau SK, Woo PC (février 2019). “Épidémiologie mondiale des coronavirus de chauve-souris” . Virus . 11 (2): 174. doi : 10.3390/v11020174 . PMC 6409556 . PMID 30791586 .
107. ^ ^{un b} Singh D, Yi SV (avril 2021). “Sur l’origine et l’évolution du SRAS-CoV-2” . Médecine expérimentale et moléculaire . 53 (4): 537–547. doi : 10.1038/s12276-021-00604-z . PMC 8050477 . PMID 33864026 .
108. ^ Jackson B, Boni MF, Bull MJ, Colleran A, Colquhoun RM, Darby AC, et al. (septembre 2021). “Génération et transmission de recombinants interlignés dans la pandémie de SRAS-CoV-2” . Cellule . 184 (20): 5179–5188.e8. doi : 10.1016/j.cell.2021.08.014 . PMC 8367733 . PMID 34499854 . S2CID 237099659 .
109. ^ ^{un b} “CoV2020” . GISAID EpifluDB . Archivé de l’original le 12 janvier 2020 . Récupéré le 12 janvier 2020 .
110. ^ Kim D, Lee JY, Yang JS, Kim JW, Kim VN, Chang H (mai 2020). “L’architecture du transcriptome du SRAS-CoV-2” . Cellule . 181 (4): 914–921.e10. doi : 10.1016/j.cell.2020.04.011 . PMC 7179501 ​​. PMID 32330414 .
111. ^ À KK, Sridhar S, Chiu KH, Hung DL, Li X, Hung IF, et al. (décembre 2021). “Leçons apprises 1 an après l’émergence du SRAS-CoV-2 menant à la pandémie de COVID-19” . Microbes émergents et infections . 10 (1): 507–535. doi : 10.1080/22221751.2021.1898291 . PMC 8006950 . PMID 33666147 .
112. ^ ^{un b} Jackson CB, Farzan M, Chen B, Choe H (janvier 2022). “Mécanismes d’entrée du SRAS-CoV-2 dans les cellules” . Revues naturelles. Biologie cellulaire moléculaire . 23 (1): 3–20. doi : 10.1038/s41580-021-00418-x . PMC 8491763 . PMID 34611326 .
113. ^ Braun E, Sauter D (2019). “Traitement des protéines à médiation par la furine dans les maladies infectieuses et le cancer” . Immunologie clinique et translationnelle . 8 (8) : e1073. doi : 10.1002/cti2.1073 . PMC 6682551 . PMID 31406574 .
114. ^ Vankadari N (août 2020). “Structure de la furine protéase se liant à la glycoprotéine de pointe SARS-CoV-2 et implications pour les cibles potentielles et la virulence” . Le Journal des lettres de chimie physique . 11 (16): 6655–6663. doi : 10.1021/acs.jpclett.0c01698 . PMC 7409919 . PMID 32787225 .
115. ^ ^{a b} Coutard B, Valle C, de Lamballerie X, Canard B, Seidah NG, Decroly E (avril 2020). “La glycoprotéine de pointe du nouveau coronavirus 2019-nCoV contient un site de clivage de type furine absent dans le CoV du même clade” . Recherche antivirale . 176 : 104742. doi : 10.1016/j.cub.2020.03.022 . PMC 7114094 . PMID 32057769 .
116. ^ Zhang T, Wu Q, Zhang Z (avril 2020). “Origine probable du pangolin du SRAS-CoV-2 associée à l’épidémie de COVID-19” . Biologie actuelle . 30 (7): 1346–1351.e2. doi : 10.1016/j.cub.2020.03.022 . PMC 7156161 . PMID 32197085 .
117. ^ Wu Y, Zhao S (décembre 2020). “Les sites de clivage de la furine se produisent naturellement dans les coronavirus” . Recherche sur les cellules souches . 50 : 102115. doi : 10.1016/j.scr.2020.102115 . PMC 7836551 . PMID 33340798 .
118. ^ Budhraja A, Pandey S, Kannan S, Verma CS, Venkatraman P (mars 2021). “L’insert polybasique, le RBD de la protéine de pointe SARS-CoV-2 et le coronavirus félin – ont évolué ou doivent encore évoluer” . Rapports de biochimie et de biophysique . 25 : 100907. doi : 10.1016/j.bbrep.2021.100907 . PMC 7833556 . PMID 33521335 .
119. ^ Worobey M, Pekar J, Larsen BB, Nelson MI, Hill V, Joy JB, et al. (Octobre 2020). “L’émergence du SRAS-CoV-2 en Europe et en Amérique du Nord” . Sciences . 370 (6516): 564–570. doi : 10.1126/science.abc8169 . PMC 7810038 . PMID 32912998 .
120. ^ “Lancement initial du génome du nouveau coronavirus” . Virologique . 11 janvier 2020. Archivé de l’original le 12 janvier 2020 . Récupéré le 12 janvier 2020 .
121. ^ ^{un b} Bedford T, Neher R, Hadfield N, Hodcroft E, Ilcisin M, Müller N. “Analyse génomique de la propagation du nCoV: rapport de situation 2020-01-30” . nextstrain.org . Archivé de l’original le 15 mars 2020 . Récupéré le 18 mars 2020 .
122. ^ Sun J, He WT, Wang L, Lai A, Ji X, Zhai X, et al. (Mai 2020). « COVID-19 : épidémiologie, évolution et perspectives interdisciplinaires » . Tendances en médecine moléculaire . 26 (5): 483–495. doi : 10.1016/j.molmed.2020.02.008 . PMC 7118693 . PMID 32359479 .
123. ^ “Épidémiologie génomique du nouveau coronavirus – Sous-échantillonnage mondial” . Prochaine souche . 25 octobre 2021. Archivé de l’original le 20 avril 2020 . Récupéré le 26 octobre 2021 .
124. ^ Groupe d’étude des Coronaviridae du Comité international sur la taxonomie des virus (avril 2020). “L’espèce Coronavirus lié au syndrome respiratoire aigu sévère : classer le 2019-nCoV et le nommer SARS-CoV-2” . Microbiologie naturelle . 5 (4): 536–544. doi : 10.1038/s41564-020-0695-z . PMC 7095448 . PMID 32123347 .
125. ^ “Une nouvelle souche plus infectieuse de COVID-19 domine désormais les cas mondiaux de virus : étude” . medicalxpress.com . Archivé de l’original le 17 novembre 2020 . Récupéré le 16 août 2020 .
126. ^ Korber B, Fischer WM, Gnanakaran S, Yoon H, Theiler J, Abfalterer W, et al. (août 2020). “Suivi des changements dans le pic de SRAS-CoV-2 : preuve que le D614G augmente l’infectiosité du virus COVID-19” . Cellule . 182 (4): 812–827.e19. doi : 10.1016/j.cell.2020.06.043 . PMC 7332439 . PMID 32697968 .
127. ^ Dhama K, Khan S, Tiwari R, Sircar S, Bhat S, Malik YS, et al. (septembre 2020). “Maladie à coronavirus 2019-COVID-19” . Examens de microbiologie clinique . 33 (4). doi : 10.1128/CMR.00028-20 . PMC 7405836 . PMID 32580969 .
128. ^ Dockrill P (11 novembre 2020). “Les scientifiques viennent de trouver un” gène dans un gène “mystérieusement caché dans le SRAS-CoV-2” . AlerteScience . Archivé de l’original le 17 novembre 2020 . Récupéré le 11 novembre 2020 .
129. ^ Nelson CW, Ardern Z, Goldberg TL, Meng C, Kuo CH, Ludwig C, et al. (Octobre 2020). « Gène de chevauchement nouveau à évolution dynamique en tant que facteur de la pandémie de SRAS-CoV-2 » . eLife . 9 . doi : 10.7554/eLife.59633 . PMC 7655111 . PMID 33001029 . Archivé de l’original le 17 novembre 2020 . Récupéré le 11 novembre 2020 .
130. ^ ^{un b} Zhou H, Ji J, Chen X, Bi Y, Li J, Wang Q, et al. (juin 2021). “L’identification de nouveaux coronavirus de chauve-souris met en lumière les origines évolutives du SRAS-CoV-2 et des virus apparentés” . Cellule . 184 (17): 4380–4391.e14. doi : 10.1016/j.cell.2021.06.008 . PMC 8188299 . PMID 34147139 .
131. ^ ^{un b} Wacharapluesadee S, Tan CW, Maneeorn P, Duengkae P, Zhu F, Joyjinda Y, et al. (février 2021). “Preuve des coronavirus liés au SRAS-CoV-2 circulant chez les chauves-souris et les Pangolins en Asie du Sud-Est” . Communication Nature . 12 (1): 972. Bibcode : 2021NatCo..12..972W . doi : 10.1038/s41467-021-21240-1 . PMC 7873279 . PMID 33563978 .
132. ^ Murakami S, Kitamura T, Suzuki J, Sato R, Aoi T, Fujii M, et al. (Décembre 2020). “Détection et caractérisation du Sarbecovirus de chauve-souris phylogénétiquement lié au SRAS-CoV-2, Japon” . Maladies infectieuses émergentes . 26 (12): 3025–3029. doi : 10.3201/eid2612.203386 . PMC 7706965 . PMID 33219796 .
133. ^ ^{un b} Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y, et al. (juin 2020). “Un nouveau coronavirus de chauve-souris étroitement lié au SRAS-CoV-2 contient des insertions naturelles au site de clivage S1/S2 de la protéine de pointe” . Biologie actuelle . 30 (11): 2196–2203.e3. doi : 10.1016/j.cub.2020.05.023 . PMC 7211627 . PMID 32416074 .
134. ^ Lam TT, Jia N, Zhang YW, Shum MH, Jiang JF, Zhu HC, et al. (juillet 2020). “Identification des coronavirus liés au SRAS-CoV-2 chez les Pangolins malais”. Nature . 583 (7815): 282–285. Bibcode : 2020Natur.583..282L . doi : 10.1038/s41586-020-2169-0 . PMID 32218527 . S2CID 214683303 .
135. ^ Xiao, Kangpeng; Zhai, Junqiong; Feng, Yaoyu; Zhou, Niu ; Zhang, Xu; Zou, Jie-Jian ; Li, Na; Guo, Yaqiong; Li, Xiaobing; Shen, Xuejuan ; Zhang, Zhipeng; Shu, Fanfan ; Huang, Wanyi ; Li, Yu; Zhang, Ziding ; Chen, Rui-Ai; Wu, Ya-Jiang ; Peng, Shi-Ming; Huang, Mian ; Xie, Wei-Jun ; Cai, Qin-Hui ; Hou, Fang-Hui ; Chen, Wu; Xiao, Lihua; Shen, Yongyi (9 juillet 2020). “Isolement du coronavirus lié au SRAS-CoV-2 des Pangolins malais”. Nature . 583 (7815): 286–289. doi : 10.1038/s41586-020-2313-x .
136. ^ ^{un b} Delaune, Deborah; Hul, Vibol ; Karlsson, Erik A.; Hassanin, Alexandre; Ou, Tey Putita ; Baidaliuk, Artem ; Gambaro, Fabiana ; Prot, Matthieu ; Tu, Vuong Tan ; Chea, Sokha ; Keatts, Lucie ; Mazet, Jonna; Johnson, Christine K.; Buchy, Philippe; Dussart, Philippe; Goldstein, Tracey; Simon-Lorière, Etienne; Duong, Veasna (9 novembre 2021). “Un nouveau coronavirus lié au SRAS-CoV-2 chez les chauves-souris du Cambodge”. Communication Nature . 12 (1) : 6563. doi : 10.1038/s41467-021-26809-4 . ISSN 2041-1723 .
137. ^ Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y, et al. (juin 2020). “Un nouveau coronavirus de chauve-souris étroitement lié au SRAS-CoV-2 contient des insertions naturelles au site de clivage S1/S2 de la protéine de pointe” . Biologie actuelle . 30 (11): 2196–2203.e3. doi : 10.1016/j.cub.2020.05.023 . PMC 7211627 . PMID 32416074 .
138. ^ Zhou, Peng; Yang, Xing-Lou; Wang, Xian-Guang ; Hu, Ben ; Zhang, Lei; Zhang, Wei; Si, Hao-Rui ; Zhu, Yan; Li, Bei ; Huang, Chao-Lin; Chen, Hui-Dong; Chen, Jing; Luo, Yun ; Guo, Hua ; Jiang, Ren-Di; Liu, Mei-Qin; Chen, Ying; Shen, Xu-Rui; Wang, Xi ; Zheng, Xiao-Shuang; Zhao, Kai ; Chen, Quan Jiao; Deng, Fei ; Liu, Lin-Lin; Yan, Bing; Zhan, Fa-Xian ; Wang, Yan-Yi; Xiao, Geng-Fu; Shi, Zheng-Li (12 mars 2020). “Une épidémie de pneumonie associée à un nouveau coronavirus d’origine probable de chauve-souris”. Nature . 579 (7798): 270–273. doi : 10.1038/s41586-020-2012-7 .
139. ^ Temmam, Sarah; Vongphayloth, Khamsing ; Baquero, Eduard; Munier, Sandie; Bonomi, Massimiliano; Regnault, Béatrice; Douangboubpha, Bounsavane; Karami, Yasaman; Chrétien, Delphine; Sanamxay, Daosavanh ; Xayaphet, Vilakhan ; Paphaphanh, Phetphoumin; Lacoste, Vincent; Somlor, Somphavanh ; Lakeomany, Khaithong ; Phommavanh, Nothasin ; Pérot, Philippe; Dehan, Océane; Amara, Faustine; Donati, Flora; Bigot, Thomas; Nilges, Michael ; Rey, Félix A.; van der Werf, Sylvie; Brey, Paul T.; Éloit, Marc (16 février 2022). “Coronavirus de chauve-souris liés au SRAS-CoV-2 et infectieux pour les cellules humaines”. Nature . doi : 10.1038/s41586-022-04532-4 .
140. ^ Koyama T, Platt D, Parida L (juillet 2020). “Analyse de variantes des génomes du SRAS-CoV-2” . Bulletin de l’Organisation mondiale de la santé . 98 (7): 495–504. doi : 10.2471/BLT.20.253591 . PMC 7375210 . PMID 32742035 . Nous avons détecté au total 65776 variants avec 5775 variants distincts.
141. ^ Alm E, Broberg EK, Connor T, Hodcroft EB, Komissarov AB, Maurer-Stroh S, et al. (août 2020). “Répartition géographique et temporelle des clades du SRAS-CoV-2 dans la région européenne de l’OMS, janvier à juin 2020” . Surveillance européenne . 25 (32). doi : 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410 . PMC 7427299 . PMID 32794443 .
142. ^ Organisation mondiale de la santé (27 novembre 2021). “Suivi des variantes du SARS-CoV-2” . Organisation mondiale de la santé . Archivé de l’original le 6 juin 2021 . Récupéré le 28 novembre 2021 .
143. ^ “Souche variante associée au vison SARS-CoV-2 – Danemark” . QUI . 3 décembre 2020. Archivé de l’original le 31 décembre 2020 . Récupéré le 30 décembre 2020 .
144. ^ Expéditeur R, Bar-On YM, Gleizer S, Bernsthein B, Flamholz A, Phillips R, Milo R (avril 2021). “Le nombre total et la masse des virions du SRAS-CoV-2” . medRxiv : 2020.11.16.20232009. doi : 10.1101/2020.11.16.20232009 . PMC 7685332 . PMID 33236021 .
145. ^ ^{un bc Wu C} , Liu Y, Yang Y, Zhang P, Zhong W, Wang Y, et al. (Mai 2020). “Analyse des cibles thérapeutiques pour le SRAS-CoV-2 et découverte de médicaments potentiels par des méthodes informatiques” . Acta Pharmaceutica Sinica B . 10 (5): 766–788. doi : 10.1016/j.apsb.2020.02.008 . PMC 7102550 . PMID 32292689 .
146. ^ ^{un b} Wrapp D, Wang N, Corbett KS, Goldsmith JA, Hsieh CL, Abiona O, et al. (mars 2020). “Structure Cryo-EM du pic 2019-nCoV dans la conformation de préfusion” . Sciences . 367 (6483): 1260–1263. Bibcode : 2020Sci…367.1260W . doi : 10.1126/science.abb2507 . PMC 7164637 . PMID 32075877 .
147. ^ Mandelbaum RF (19 février 2020). “Les scientifiques créent une image au niveau atomique du talon d’Achille potentiel du nouveau coronavirus” . Gizmodo . Archivé de l’original le 8 mars 2020 . Récupéré le 13 mars 2020 .
148. ^ ^{un bc Aronson} JK (25 mars 2020). “Coronavirus – une introduction générale” . Centre de médecine factuelle, Nuffield Department of Primary Care Health Sciences, University of Oxford . Archivé de l’original le 22 mai 2020 . Récupéré le 24 mai 2020 .
149. ^ Sokhansanj, Bahrad A.; Rosen, Gail L. (26 avril 2022). Gaglia, Marta M. (éd.). « Cartographier les données pour une compréhension approfondie : tirer le meilleur parti du déluge de séquences du génome du SRAS-CoV-2 » . mSystèmes . 7 (2) : e00035–22. doi : 10.1128/msystems.00035-22 . ISSN 2379-5077 .
150. ^ Kandeel M, Ibrahim A, Fayez M, Al-Nazawi M (juin 2020). « Du SRAS et du MERS CoV au SRAS-CoV-2 : vers une utilisation plus biaisée des codons dans les gènes structuraux et non structuraux viraux » . Journal de virologie médicale . 92 (6): 660–666. doi : 10.1002/jmv.25754 . PMC 7228358 . PMID 32159237 .
151. ^ ^{un b} Hou W (septembre 2020). “Caractérisation du modèle d’utilisation des codons dans le SRAS-CoV-2” . Journal de virologie . 17 (1): 138. doi : 10.1186/s12985-020-01395-x . PMC 7487440 . PMID 32928234 .
152. ^ ^{un b} Wang Y, Mao JM, Wang GD, Luo ZP, Yang L, Yao Q, Chen KP (juillet 2020). “Le SRAS-CoV-2 humain a évolué pour réduire le dinucléotide CG dans ses cadres de lecture ouverts” . Rapports scientifiques . 10 (1) : 12331. Bibcode : 2020NatSR..1012331W . doi : 10.1038/s41598-020-69342-y . PMC 7378049 . PMID 32704018 .
153. ^ Rice AM, Castillo Morales A, Ho AT, Mordstein C, Mühlhausen S, Watson S, et al. (janvier 2021). “Preuve d’un fort biais de mutation vers et sélection contre le contenu U dans le SRAS-CoV-2 : Implications pour la conception de vaccins” . Biologie moléculaire et évolution . 38 (1): 67–83. doi : 10.1093/molbev/msaa188 . PMC 7454790 . PMID 32687176 .
154. ^ Gu H, Chu DK, Peiris M, Poon LL (janvier 2020). “Analyses multivariées de l’utilisation des codons du SRAS-CoV-2 et d’autres bêtacoronavirus” . Évolution des virus . 6 (1) : veaa032. doi : 10.1093/ve/veaa032 . PMC 7223271 . PMID 32431949 .
155. ^ Wang Q, Zhang Y, Wu L, Niu S, Song C, Zhang Z, et al. (Mai 2020). “Base structurelle et fonctionnelle de l’entrée du SRAS-CoV-2 à l’aide de l’ACE2 humain” . Cellule . 181 (4) : 894–904.e9. doi : 10.1016/j.cell.2020.03.045 . PMC 7144619 . PMID 32275855 .
156. ^ Xu X, Chen P, Wang J, Feng J, Zhou H, Li X, et al. (mars 2020). “Évolution du nouveau coronavirus à partir de l’épidémie de Wuhan en cours et modélisation de sa protéine de pointe pour le risque de transmission humaine” . Sciences Chine Sciences de la vie . 63 (3): 457–460. doi : 10.1007/s11427-020-1637-5 . PMC 7089049 . PMID 32009228 .
157. ^ Letko M, Marzi A, Munster V (avril 2020). “Évaluation fonctionnelle de l’entrée dans les cellules et de l’utilisation des récepteurs pour le SRAS-CoV-2 et d’autres bêtacoronavirus de la lignée B” . Microbiologie naturelle . 5 (4): 562–569. doi : 10.1038/s41564-020-0688-y . PMC 7095430 . PMID 32094589 .
158. ^ Letko M, Marzi A, Munster V (avril 2020). “Évaluation fonctionnelle de l’entrée dans les cellules et de l’utilisation des récepteurs pour le SRAS-CoV-2 et d’autres bêtacoronavirus de la lignée B” . Microbiologie naturelle . 5 (4): 562–569. doi : 10.1038/s41564-020-0688-y . PMC 7095430 . PMID 32094589 .
159. ^ El Sahly HM. “Caractérisation génomique du nouveau coronavirus 2019” . Le New England Journal of Medicine . Archivé de l’original le 17 février 2020 . Récupéré le 9 février 2020 .
160. ^ “La structure du nouveau coronavirus révèle des cibles pour les vaccins et les traitements” . Instituts nationaux de la santé (NIH) . 2 mars 2020. Archivé de l’original le 1er avril 2020 . Récupéré le 3 avril 2020 .
161. ^ Wang K, Chen W, Zhang Z, Deng Y, Lian JQ, Du P, et al. (Décembre 2020). “La protéine CD147-spike est une nouvelle voie d’infection par le SRAS-CoV-2 vers les cellules hôtes” . Transduction du signal et thérapie ciblée . 5 (1): 283. bioRxiv 10.1101/2020.03.14.988345 . doi : 10.1038/s41392-020-00426-x . PMC 7714896 . PMID 33277466 . S2CID 214725955 .
162. ^ Zamorano Cuervo N, Grandvaux N (novembre 2020). « ACE2 : preuve du rôle en tant que récepteur d’entrée pour le SRAS-CoV-2 et implications dans les comorbidités » . eLife . 9 . doi : 10.7554/eLife.61390 . PMC 7652413 . PMID 33164751 .
163. ^ “Anatomie d’un tueur : Comprendre le SRAS-CoV-2 et les médicaments qui pourraient diminuer sa puissance” . L’Économiste . 12 mars 2020. Archivé de l’original le 14 mars 2020 . Récupéré le 14 mars 2020 .
164. ^ Beeching NJ, Fletcher TE, Fowler R (22 mai 2020). “Meilleures pratiques BMJ : maladie à coronavirus 2019 (COVID-19)” (PDF) . BMJ . Archivé (PDF) de l’original le 13 juin 2020 . Récupéré le 25 mai 2020 .
165. ^ Drayman N, DeMarco JK, Jones KA, Azizi SA, Froggatt HM, Tan K, et al. (août 2021). “Le masitinib est un large inhibiteur du coronavirus 3CL qui bloque la réplication du SRAS-CoV-2” . Sciences . 373 (6557): 931–936. Bibcode : 2021Sci…373..931D . doi : 10.1126/science.abg5827 . PMC 8809056 . PMID 34285133 .
166. ^ Fiche d’information pour les prestataires de soins de santé: autorisation d’utilisation d’urgence pour Paxlovid (PDF) (rapport technique). Pfizer . 22 décembre 2021. LAB-1492-0.8. Archivé de l’original le 23 décembre 2021.
167. ^ “Paxlovide EPAR” . Agence européenne des médicaments (EMA) . 24 janvier 2022 . Récupéré le 3 février 2022 . Le texte a été copié à partir de cette source qui est protégée par le droit d’auteur de l’Agence européenne des médicaments. La reproduction est autorisée moyennant mention de la source.
168. ^ “Antiviral COVID-19 oral, Paxlovid, approuvé par le régulateur britannique” (Communiqué de presse). Agence de réglementation des médicaments et des produits de santé. 31 décembre 2021.
169. ^ “Santé Canada autorise Paxlovid pour les patients atteints de COVID-19 léger à modéré à haut risque de développer une maladie grave” . Santé Canada (Communiqué de presse). 17 janvier 2022 . Récupéré le 24 avril 2022 .
170. ^ “La FDA autorise le premier antiviral oral pour le traitement du COVID-19” . Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis (Communiqué de presse). 22 décembre 2021 . Récupéré le 22 décembre 2021 . Cet article incorpore le texte de cette source, qui est dans le domaine public .
171. ^ Whipple T (23 octobre 2021). “Moonshot est la clé dans les travaux Covid-19 dont le pays a besoin” . Le Temps . Récupéré le 5 novembre 2021 .
172. ^ Rocklöv J, Sjödin H, Wilder-Smith A (mai 2020). “Épidémie de COVID-19 sur le bateau de croisière Diamond Princess : estimation du potentiel épidémique et de l’efficacité des contre-mesures de santé publique” . Journal de médecine de voyage . 27 (3). doi : 10.1093/jtm/taaa030 . PMC 7107563 . PMID 32109273 .
173. ^ Ke R, Romero-Severson E, Sanche S, Hengartner N (mai 2021). “Estimation du nombre reproducteur R ₀ du SRAS-CoV-2 aux États-Unis et dans huit pays européens et implications pour la vaccination” . Journal de biologie théorique . 517 : 110621. Bibcode : 2021JThBi.51710621K . doi : 10.1016/j.jtbi.2021.110621 . PMC 7880839 . PMID 33587929 .
174. ^ Liu Y, Gayle AA, Wilder-Smith A, Rocklöv J (mars 2020). “Le nombre reproducteur de COVID-19 est plus élevé que celui du coronavirus du SRAS” . Journal de médecine de voyage . 27 (2) : taaa021. doi : 10.1093/jtm/taaa021 . PMC 7074654 . PMID 32052846 .
175. ^ Davies NG, Abbott S, Barnard RC, Jarvis CI, Kucharski AJ, Munday JD, et al. (avril 2021). “Transmissibilité estimée et impact de la lignée SARS-CoV-2 B.1.1.7 en Angleterre” . Sciences . 372 (6538) : eabg3055. doi : 10.1126/science.abg3055 . PMC 8128288 . PMID 33658326 .
176. ^ Liu Y, Rocklöv J (octobre 2021). “Le nombre reproducteur de la variante Delta du SARS-CoV-2 est bien plus élevé que celui du virus ancestral SARS-CoV-2” . Journal de médecine de voyage . 28 (7) : taab124. doi : 10.1093/jtm/taab124 . PMC 8436367 . PMID 34369565 .
177. ^ ^{un bcd ” Tableau de bord COVID} -19 par le Centre pour la science et l’ingénierie des systèmes (CSSE) à l’Université Johns Hopkins (JHU) ” . ArcGIS . Université John Hopkins . Récupéré le 15 mai 2022 .
178. ^ Branswell H (30 janvier 2020). “Des données limitées sur le coronavirus peuvent fausser les hypothèses sur la gravité” . STAT . Archivé de l’original le 1er février 2020 . Récupéré le 13 mars 2020 .
179. ^ Wu JT, Leung K, Leung GM (février 2020). “Création immédiate et prévision de la propagation nationale et internationale potentielle de l’épidémie de 2019-nCoV originaire de Wuhan, en Chine : une étude de modélisation” . Lancette . 395 (10225): 689–697. doi : 10.1016/S0140-6736(20)30260-9 . PMC 7159271 . PMID 32014114 .
180. ^ Boseley S, McCurry J (30 janvier 2020). “Les décès par coronavirus bondissent en Chine alors que les pays luttent pour évacuer les citoyens” . Le Gardien . Archivé de l’original le 6 février 2020 . Récupéré le 10 mars 2020 .
181. ^ Paulinus A (25 février 2020). « Coronavirus : la Chine doit remercier l’Afrique pour la sauvegarde de la santé publique » . Le Soleil . Archivé de l’original le 9 mars 2020 . Récupéré le 10 mars 2020 .

Lectures complémentaires

• Bar-On YM, Flamholz A, Phillips R, Milo R (avril 2020). “SARS-CoV-2 (COVID-19) en chiffres” . eLife . 9 . arXiv : 2003.12886 . Bibcode : 2020arXiv200312886B . doi : 10.7554/eLife.57309 . PMC 7224694 . PMID 32228860 .
• Brüssow H (mai 2020). “Le nouveau coronavirus – Un aperçu des connaissances actuelles” . Biotechnologie microbienne . 13 (3): 607–612. doi : 10.1111/1751-7915.13557 . PMC 7111068 . PMID 32144890 .
• Cascella M, Rajnik M, Aleem A, Dulebohn S, Di Napoli R (janvier 2020). « Caractéristiques, évaluation et traitement du coronavirus (COVID-19) » . StatPearls . PMID 32150360 . Archivé de l’original le 6 avril 2020 . Récupéré le 4 avril 2020 .
• Tests de laboratoire pour la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) chez les cas humains suspects (Rapport). Organisation mondiale de la santé . 2 mars 2020. hdl : 10665/331329 .
• Zoumpourlis V, Goulielmaki M, Rizos E, Baliou S, Spandidos DA (octobre 2020). “[Commentaire] La pandémie de COVID‐19 comme défi scientifique et social au 21e siècle” . Rapports de médecine moléculaire (examen). 22 (4): 3035–3048. doi : 10.3892/mmr.2020.11393 . PMC 7453598 . PMID 32945405 .

Liens externes

Scholia a un profil pour le SRAS-CoV-2 (Q82069695) .

• “Maladie à coronavirus 2019 (COVID-19)” . Centres de contrôle et de prévention des maladies (CDC) . 11 février 2020.
• “Pandémie de maladie à coronavirus (COVID-19)” . Organisation mondiale de la santé (OMS) .
• “Séquences du SRAS-CoV-2 (coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2)” . Centre national d’information sur la biotechnologie (NCBI) .
• “Centre de ressources COVID-19” . Le Lancet .
• “Coronavirus (Covid-19)” . Le New England Journal of Medicine .
• « Covid-19 : nouvelle épidémie de coronavirus » . Wiley .
• “SRAS-CoV-2” . Base de données sur les virus pathogènes et ressource d’analyse .
• “Structures protéiques liées au SARS-CoV-2” . Banque de données sur les protéines .

Portails : COVID-19 [feminine] Médecine Virus Syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 sur les projets frères de Wikipédia : Définitions du Wiktionnaire Médias de Commons Nouvelles de Wikinews Citations de Wikiquote Textes de Wikisource Manuels de Wikibooks Guides de voyage de Wikivoyage Ressources de Wikiversité Données de Wikidata Taxons de Wikispecies