Système d’information taxonomique intégré
L’ Integrated Taxonomic Information System ( ITIS ) est un partenariat américain d’agences fédérales conçu pour fournir des informations cohérentes et fiables sur la taxonomie des espèces biologiques . [1] ITIS a été formé à l’origine en 1996 en tant que groupe interinstitutions au sein du gouvernement fédéral américain , impliquant plusieurs agences fédérales américaines, et est maintenant devenu un organisme international, avec la participation d’agences gouvernementales canadiennes et mexicaines . La base de données s’appuie sur une large communauté d’experts en taxonomie. Le personnel du contenu principal est hébergé au Smithsonian National Museum of Natural Historyet les services informatiques sont fournis par une installation de l’ US Geological Survey à Denver. L’ITIS se concentre principalement sur les espèces nord-américaines, mais de nombreux groupes biologiques existent dans le monde et l’ITIS collabore avec d’autres agences pour accroître sa couverture mondiale. [2]
Site Web : itis.gov
Base de données de référence
ITIS fournit une base de données de référence automatisée des noms scientifiques et communs des espèces. En mai 2016, il contient plus de 839 000 noms scientifiques, synonymes et noms communs pour les taxons terrestres, marins et d’eau douce de tous les règnes biologiques (animaux, plantes, champignons et microbes). Bien que le système se concentre au minimum sur les espèces nord-américaines, il comprend également de nombreuses espèces introuvables en Amérique du Nord, en particulier parmi les oiseaux, les poissons, les amphibiens, les mammifères, les bactéries, de nombreux reptiles, plusieurs groupes de plantes et de nombreux groupes d’animaux invertébrés. [3] [4] Les données présentées dans ITIS sont considérées comme des informations publiques et peuvent être librement distribuées et copiées, bien qu’une citation appropriée [5] soit requise. Le SITI est fréquemment utilisé comme outil de factosource de données taxonomiques dans les projets d’ informatique de la biodiversité . [6]
Le SITI associe chaque nom scientifique à un numéro de série taxonomique (TSN) stable et unique en tant que « dénominateur commun » pour accéder à des informations sur des questions telles que les espèces envahissantes, les amphibiens en déclin, les oiseaux migrateurs, les stocks halieutiques, les pollinisateurs, les ravageurs agricoles et les maladies émergentes. Il présente les noms dans une classification standard qui contient l’auteur, la date, la distribution et les informations bibliographiques liées aux noms. De plus, les noms communs sont disponibles via le SITI dans les principales langues officielles des Amériques ( anglais , français , espagnol et portugais ).
Catalogue de la vie
ITIS et son partenaire international, Species 2000 , coopèrent pour produire chaque année le Catalogue of Life , une liste de contrôle et un index des espèces du monde. L’objectif du catalogue de la vie était de compléter la liste de contrôle mondiale de 1,9 million d’espèces d’ici 2011 . date catalogue complet de tous les organismes vivants. [8] [9]
ITIS et le catalogue de la vie sont au cœur de l’ initiative Encyclopédie de la vie annoncée en mai 2007. [10] EOL sera construit en grande partie sur diverses licences Creative Commons . [11]
Ancienne base de données
Sur les ~714 000 (mai 2016) noms scientifiques de la base de données actuelle, environ 210 000 ont été hérités de la base de données anciennement gérée par le National Oceanographic Data Center (NODC) de la National Oceanic and Atmospheric Administration (NOAA) des États-Unis. [4] [12] Le matériel le plus récent a été vérifié selon des normes plus élevées de crédibilité taxonomique, et plus de la moitié du matériel original a été vérifié et amélioré selon la même norme. [4]
S’appuyant sur les efforts de Richard Swartz, Marvin Wass et Donald Boesch en 1972 pour établir un système de codage numérique «intelligent» pour la taxonomie, la première édition du NODC Taxonomic Code a été publiée en 1977. Des éditions papier ont été publiées jusqu’en 1984. Éditions suivantes ont été publiés numériquement jusqu’en 1996. 1996 a marqué la sortie de la version 8 de NODC, qui a servi de pont vers ITIS, qui a abandonné les codes numériques «intelligents» au profit de numéros de série taxonomiques plus stables, mais «non intelligents». [12]
Normes
La taxonomie biologique n’est pas figée et les opinions sur le statut correct des taxons à tous les niveaux et leur placement correct sont constamment révisées à la suite de nouvelles recherches. De nombreux aspects de la classification restent une question de jugement scientifique. La base de données ITIS est mise à jour pour tenir compte des nouvelles recherches au fur et à mesure qu’elles deviennent disponibles. [ citation nécessaire ]
Les enregistrements au sein du SITI contiennent des informations sur la mesure dans laquelle il a été possible de les contrôler et de les vérifier. Ses informations doivent être vérifiées par rapport à d’autres sources lorsqu’elles sont disponibles, et par rapport à la littérature scientifique de recherche primaire lorsque cela est possible.
Agences membres
- Agriculture et Agroalimentaire Canada
- Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
- L’administration nationale des océans et de l’atmosphère
- Service des parcs nationaux
- NatureServe
- Institution Smithsonian
- département de l’agriculture des Etats-Unis
- Agence de protection de l’environnement des États-Unis
- Service géologique des États-Unis
- Service de la pêche et de la faune des États-Unis
Voir également
- Encyclopédie de la vie
- Liste des plantes
- Espèces Wiki
- Registre mondial des espèces marines
Références
- ^ “Le Mémorandum d’Accord d’ITIS” . Système d’information taxonomique intégré . Récupéré le 04/04/2008 .
- ^ Coote, Lonny D; et coll. (février 2008). “Suivi du commerce international des espèces sauvages avec des données d’espèces codées”. Biologie de la conservation . 22 (1): 4–7. doi : 10.1111/j.1523-1739.2007.00857.x . PMID 18254847 .
- ^ “Système d’information taxonomique intégré” . Système d’information taxonomique intégré. Archivé de l’original le 2016-06-06 . Récupéré le 30/05/2016 .
- ^ un bc ” l’Histoire de Développement de Données et la Qualité de Données “ . Système d’information taxonomique intégré . Récupéré le 30/05/2016 .
- ^ “Citation ITIS” . Récupéré le 09/05/2012 .
- ^ Page, DMR (2005-04-09). « Un moteur de recherche taxonomique : fédérer des bases de données taxonomiques à l’aide de services Web » . BMC Bioinformatique . 6 : 48. doi : 10.1186/1471-2105-6-48 . PMC 555944 . PMID 15757517 .
- ^ Guralnick, RP; et coll. (septembre 2007). “Vers une infrastructure mondiale collaborative pour l’évaluation de la biodiversité” . Lettres d’écologie . 10 (8): 663–672. doi : 10.1111/j.1461-0248.2007.01063.x . PMC 2040220 . PMID 17594421 .
- ^ “Lancement d’un million d’espèces du catalogue de la vie” (communiqué de presse). Université de Reading . 2007-03-29 . Récupéré le 16/03/2008 .
- ^ “À propos du catalogue de la vie: liste de contrôle annuelle 2012” . Catalogue de la vie . Système d’information taxonomique intégré (ITIS) . Récupéré le 22 mai 2012 .
- ^ “Les principaux scientifiques annoncent la création de l’encyclopédie de la vie” . Quotidien des Sciences . 9 mai 2007. Adapté d’un communiqué de presse de l’Université de Harvard .
- ^ “Conditions d’utilisation – Encyclopédie de la vie” . Encyclopédie de la vie .
- ^ un b “le Code Taxonomique de NODC” . Centre national de données océanographiques . Récupéré le 04/04/2008 .
Liens externes
Wikidata a la propriété :
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- Système d’information taxonomique intégré (ITIS)
- Interface Canada : Système d’information taxonomique intégré (ITIS*CA)
- Interface Mexique : Sistema Integrado de Información Taxonómica (SIIT*MX) (lien archivé)
- Interface Brésil : Sistema Integrado de Informação Taxonômica – (SIIT*Brasil) [ lien mort ]