Centre PubMed
PubMed Central ( PMC ) est un Référentiel numérique gratuit qui archive des articles scientifiques en texte intégral en accès libre qui ont été publiés dans des revues biomédicales et des Sciences de la vie . En tant que l’une des principales bases de données de recherche développées par le National Center for Biotechnology Information (NCBI), PubMed Central est plus qu’un référentiel de documents. Les soumissions à PMC sont indexées et formatées pour des métadonnées améliorées, une ontologie médicale et des identifiants uniques qui enrichissent les données structurées XML pour chaque article. [1] Le contenu de PMC peut être lié à d’autres bases de données NCBI et accessible viaEntrez les systèmes de recherche et de récupération, améliorant encore la capacité du public à découvrir, lire et développer ses connaissances biomédicales. [2]
Producteur | Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis (États-Unis) |
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Histoire | 2000 à aujourd’hui |
Accéder | |
Coût | Libre |
Couverture | |
Disciplines | Médecine |
Profondeur d’enregistrement | Index, résumé et texte intégral |
Couverture des formats | Articles de journaux |
Liens | |
Site Internet | https://www.ncbi.nlm.NIH.gov/pmc/ |
Liste(s) de titres | https://www.ncbi.nlm.NIH.gov/pmc/journals/ |
PubMed Central est distinct de PubMed . [3] PubMed Central est une archive numérique gratuite d’articles complets, accessible à tous de n’importe où via un navigateur Web (avec diverses dispositions de réutilisation). Inversement, bien que PubMed soit une base de données consultable de citations et de résumés biomédicaux, l’article en texte intégral réside ailleurs (en version imprimée ou en ligne, gratuit ou derrière un mur payant d’abonné ) .
En décembre 2018 [mettre à jour], les archives PMC contenaient plus de 5,2 millions d’articles, [4] avec des contributions provenant d’éditeurs ou d’auteurs déposant leurs manuscrits dans le référentiel conformément à la politique d’accès public des NIH . Des données antérieures montrent que de janvier 2013 à janvier 2014, les dépôts initiés par l’auteur ont dépassé 103 000 articles sur une période de 12 mois. [5] PMC identifie environ 4 000 revues qui participent dans une certaine mesure à déposer leur contenu publié dans le référentiel PMC. [6]Certains éditeurs retardent la publication de leurs articles sur PubMed Central pendant un temps déterminé après la publication, appelé « période d’embargo », allant de quelques mois à quelques années selon les revues. (Les embargos de six à douze mois sont les plus courants.) PubMed Central est un exemple clé de “distribution externe systématique par un tiers”, [7] qui est toujours interdite par les accords de contributeur de nombreux éditeurs.
Adoption
Lancé en février 2000, le référentiel s’est développé rapidement car la politique d’accès public du NIH est conçue pour rendre toutes les recherches financées par les National Institutes of Health (NIH) librement accessibles à tous, et, en outre, de nombreux éditeurs travaillent en coopération avec le NIH donner libre accès à leurs œuvres. À la fin de 2007, la loi de 2008 sur les crédits consolidés (HR 2764) a été promulguée et comprenait une disposition obligeant les NIH à modifier leurs politiques et à exiger l’inclusion dans PubMed Central de copies électroniques complètes de leurs recherches évaluées par des pairs et des résultats de recherches financées par les NIH. rechercher. Ces articles doivent être inclus dans les 12 mois suivant leur publication. C’est la première fois que le gouvernement américain demande à une agence de fournir un accès ouvertà la recherche et constitue une évolution par rapport à la politique de 2005, dans laquelle le NIH demandait aux chercheurs d’ajouter volontairement leurs recherches à PubMed Central. [8]
Une version britannique du système PubMed Central, UK PubMed Central (UKPMC) , a été développée par le Wellcome Trust et la British Library dans le cadre d’un groupe de neuf bailleurs de fonds britanniques pour la recherche. Ce système a été mis en service en janvier 2007. Le 1er novembre 2012, il est devenu Europe PubMed Central . Le membre canadien du réseau PubMed Central International, PubMed Central Canada , a été lancé en octobre 2009.
Le langage de balisage des articles de revue “NLM Journal Publishing Tag Set” de la National Library of Medicine est disponible gratuitement. [9] L’ Association des éditeurs de sociétés savantes et professionnelles commente que “il est susceptible de devenir la norme pour la préparation de contenu scientifique pour les livres et les revues”. [10] Une DTD associée est disponible pour les livres. [11] La Bibliothèque du Congrès et la British Library ont annoncé leur soutien à la NLM DTD. [12] Il a également été populaire auprès des fournisseurs de services de revues. [13]
Avec la publication de plans d’accès public pour de nombreuses agences au-delà des NIH, PMC est en train de devenir le référentiel d’une plus grande variété d’articles. [14] Cela inclut le contenu de la NASA, avec l’interface marquée comme “PubSpace”. [15] [16]
Technologie
Les articles sont envoyés à PubMed Central par les éditeurs au format XML ou SGML , à l’ aide de diverses DTD d’ articles . Les éditeurs plus anciens et plus grands peuvent avoir leurs propres DTD internes, mais de nombreux éditeurs utilisent le NLM Journal Publishing DTD (voir ci-dessus).
Les articles reçus sont convertis via XSLT en la très similaire NLM Archiving and Interchange DTD. Ce processus peut révéler des erreurs qui sont signalées à l’éditeur pour correction. Les graphiques sont également convertis en formats et tailles standard. Les formulaires originaux et convertis sont archivés. Le formulaire converti est déplacé dans une base de données relationnelle, avec les fichiers associés pour les graphiques, le multimédia ou d’autres données associées. De nombreux éditeurs fournissent également des PDF de leurs articles, et ceux-ci sont mis à disposition sans modification. [17]
Les citations bibliographiques sont analysées et automatiquement liées aux résumés pertinents dans PubMed, aux articles dans PubMed Central et aux ressources sur les sites Web des éditeurs. Les liens PubMed mènent également à PubMed Central. Les références insolubles, telles que des revues ou des articles particuliers qui ne sont pas encore disponibles dans l’une de ces sources, sont suivies dans la base de données et sont automatiquement mises en ligne lorsque les ressources deviennent disponibles.
Un système d’indexation interne offre une capacité de recherche et connaît la terminologie biologique et médicale , comme les noms de médicaments génériques par rapport aux noms de marque, et les noms alternatifs pour les organismes, les maladies et les parties anatomiques.
Lorsqu’un utilisateur accède à un numéro de revue, une table des matières est automatiquement générée en récupérant tous les articles, lettres, éditoriaux, etc. pour ce numéro. Lorsqu’un élément réel tel qu’un article est atteint, PubMed Central convertit le balisage NLM en HTML pour la livraison et fournit des liens vers des objets de données connexes. Cela est possible car la variété des données entrantes a d’abord été convertie en DTD standard et en formats graphiques.
Dans un flux de soumission séparé, les auteurs financés par les NIH peuvent déposer des articles dans PubMed Central en utilisant la soumission de manuscrits des NIH (NIHMS). Les articles ainsi soumis passent généralement par un balisage XML afin d’être convertis en NLM DTD.
Réception
Les réactions à PubMed Central parmi la communauté de l’édition savante vont d’un véritable enthousiasme de certains [18] à une inquiétude prudente de la part d’autres. [19]
Alors que PMC est un partenaire bienvenu pour les éditeurs en libre accès dans sa capacité à augmenter la découverte et la diffusion des connaissances biomédicales, cette même vérité amène les autres à s’inquiéter du détournement du trafic de la version publiée du dossier , des conséquences économiques d’une baisse du lectorat, ainsi que que l’effet sur le maintien d’une communauté de savants au sein des sociétés savantes. [20] [21] Une analyse de 2013 a trouvé des preuves solides que les référentiels publics d’articles publiés étaient responsables “d’éloigner un nombre important de lecteurs des sites Web de revues” et que “l’effet de PMC augmente avec le temps”. [22]
Les bibliothèques, les universités, les partisans du libre accès, les groupes de défense de la santé des consommateurs et les organisations de défense des droits des patients ont applaudi PubMed Central et espèrent voir des référentiels d’accès public similaires développés par d’autres agences de financement fédérales afin de partager librement toutes les publications de recherche résultant du soutien des contribuables. . [23]
L’étude Antelman sur la publication en libre accès a révélé qu’en philosophie, en sciences politiques, en génie électrique et électronique et en mathématiques, les articles en libre accès avaient un plus grand impact sur la recherche. [24] Un essai randomisé a révélé une augmentation des téléchargements de contenu d’articles en libre accès, sans avantage de citation par rapport à l’accès par abonnement un an après la publication. [25]
La politique des NIH et le travail de dépôt en libre accès ont inspiré une directive présidentielle de 2013 qui a également suscité des actions dans d’autres agences fédérales.
En mars 2020, PubMed Central a accéléré ses procédures de dépôt du texte intégral des publications sur le coronavirus . Le NLM l’a fait à la demande du Bureau de la politique scientifique et technologique de la Maison Blanche et de scientifiques internationaux afin d’améliorer l’accès pour les scientifiques, les prestataires de soins de santé, les innovateurs en exploration de données , les chercheurs en soins de santé en IA et le grand public. [26]
PMCID
Le PMCID (identifiant PubMed Central), également connu sous le nom de numéro de référence PMC, est un identifiant Bibliographique pour la base de données en libre accès PubMed Central, tout comme le PMID est l’identifiant Bibliographique pour la base de données PubMed . Les deux identifiants sont cependant distincts. Il se compose de “PMC” suivi d’une chaîne de sept chiffres. Le format est : [27]
- PMCID : PMC1852221
Les auteurs qui postulent pour les prix NIH doivent inclure le PMCID dans leur candidature.
Voir également
- Europe PubMed Centrale
- JATS (technologie)
- MEDLINE , une base de données internationale sur la littérature des Sciences de la vie et des informations biomédicales
- PMID (Identifiant PubMed)
- PubMed Centre du Canada
- Redalyc (projet similaire axé sur l’Amérique latine)
- SciELO (service similaire)
Références
- ^ Beck J (2010). “Rapport du terrain: PubMed Central, une archive XML d’articles de journaux sur les Sciences de la vie“. Actes du Symposium international sur XML pour le long terme : problèmes de préservation à long terme de XML . 6 . doi : 10.4242/BalisageVol6.Beck01 . ISBN 978-1-935958-02-4.
- ^ Maloney C, Sequeira E, Kelly C, Orris R, Beck J (5 décembre 2013). PubMed centrale . Centre national d’information sur la biotechnologie (États-Unis).
- ^ “MEDLINE, PubMed et PMC (PubMed Central): En quoi sont-ils différents?” . www.nlm.NIH.gov . 9 septembre 2019.
- ^ “L’ouverture par défaut”, Inside Higher Ed , 16 janvier 2017.
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- ^ “Accueil – PMC – NCBI” . www.ncbi.nlm.NIH.gov .
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- ^ “L’autisme parle annonce une nouvelle politique pour donner aux familles un accès facile et gratuit aux principaux résultats de la recherche – Communiqué de presse – L’autisme parle” . www.autismspeaks.org . 25 juillet 2012.
- ^ Antelman, Kristin (2004). « Les articles en libre accès ont-ils un plus grand impact sur la recherche ? » . Bibliothèques universitaires et de recherche . 65 (5): 372–382. doi : 10.5860/crl.65.5.372 . , résumé par Stemper J, Williams K (2006). “Communication savante : Transformer la crise en opportunité” . Nouvelles des bibliothèques universitaires et de recherche . 67 (11): 692–696. doi : 10.5860/crln.67.11.7720 .
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- ^ “La Bibliothèque nationale de médecine élargit l’accès à la littérature sur les coronavirus via PubMed Central” . Instituts nationaux de la santé (NIH) . 2020-03-25 . Récupéré le 31/03/2020 . Pour soutenir cette initiative, NLM adapte ses procédures standard de dépôt d’articles dans PMC afin d’offrir une plus grande flexibilité qui garantira que la recherche sur les coronavirus est facilement disponible.
- ^ “Inclure PMCID dans les Citations | publicaccess.NIH.gov” . publicaccess.NIH.gov . Récupéré le 01/07/2017 .
Liens externes
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