Nomenclature binominale

En taxonomie , la nomenclature binomiale (“système de dénomination à deux termes”), également appelée nomenclature binominale ( “système de dénomination à deux noms”) ou nomenclature binaire , est un système formel de dénomination des espèces d’êtres vivants en donnant à chacune un nom composé de deux parties, qui utilisent toutes deux des formes grammaticales latines , bien qu’elles puissent être basées sur des mots d’autres langues. Un tel nom est appelé un nom binomial (qui peut être abrégé en “binomial”), un binôme , un nom binominal ou un nom scientifique ; plus officieusement, on l’appelle aussi un nom latin .

Orcinus orca , l’ orque ou l’épaulard Echinopsis pachanoi , le cactus de San Pedro

La première partie du nom – le nom générique – identifie le genre auquel appartient l’espèce, tandis que la seconde partie – le nom spécifique ou l’épithète spécifique – distingue l’espèce au sein du genre. Par exemple, les humains modernes appartiennent au genre Homo et au sein de ce genre à l’espèce Homo sapiens . Tyrannosaurus rex est probablement le binôme le plus connu. ^[1] L’ introduction formelle de ce système de dénomination des espèces est attribuée à Carl Linnaeus , commençant effectivement par son travail Species Plantarum en 1753. ^[2]Mais dès 1622, Gaspard Bauhin introduisit dans son livre Pinax theatri botanici (en anglais, Exposition illustrée de plantes ) de nombreux noms de genres qui furent ensuite adoptés par Linnaeus. ^[3]

L’application de la nomenclature binomiale est désormais régie par divers codes de règles internationalement reconnus, dont les deux plus importants sont le Code international de Nomenclature zoologique ( ICZN ) pour les animaux et le Code international de nomenclature pour les algues, les champignons et les plantes ( ICNafp ) . Bien que les principes généraux qui sous-tendent la nomenclature binomiale soient communs à ces deux codes, il existe certaines différences, tant dans la terminologie qu’ils utilisent que dans leurs règles particulières.

Dans l’usage moderne, la première lettre du nom générique est toujours en majuscule par écrit, tandis que celle de l’épithète spécifique ne l’est pas, même lorsqu’elle est dérivée d’un nom propre tel que le nom d’une personne ou d’un lieu. De même, les deux parties sont en italique dans le texte normal (ou soulignées en écriture manuscrite). Ainsi, le nom binomial du phlox annuel (du nom du botaniste Thomas Drummond ) s’écrit désormais Phlox drummondii . Souvent, après l’introduction d’un nom d’espèce dans un texte, le nom générique est abrégé à la première lettre dans les mentions suivantes (par exemple, P. drummondii ).

Dans les travaux scientifiques, l’ autorité d’un nom binomial est généralement donnée, du moins lors de sa première mention, et l’année de publication peut être spécifiée.

• En zoologie
  • ” Rotule vulgaire Linné, 1758″. Le nom “Linnaeus” indique au lecteur qui a publié le nom et la description de cette espèce de patelle ; 1758 est l’année où le nom et la description originale ont été publiés (dans ce cas, dans la 10e édition du livre Systema Naturae ).
  • ” Passer domesticus (Linnaeus, 1758)”. Le nom original donné par Linnaeus était Fringilla domestica ; les parenthèses indiquent que l’espèce est maintenant placée dans un genre différent. L’ICZN n’exige pas que le nom de la personne qui a changé le genre soit donné, ni la date à laquelle le changement a été effectué, bien que les catalogues de nomenclature incluent généralement ces informations.
• En botanique
  • ” Amaranthus retroflexus L.” – “L.” est l’abréviation standard utilisée pour “Linnaeus”.
  • ” Hyacinthoides italica (L.) Rothm.” – Linnaeus a d’abord nommé cette espèce de jacinthe des bois Scilla italica ; Rothmaler l’a transféré au genre Hyacinthoides ; l’ ICNafp n’exige pas que les dates de publication soient précisées.

Origine

Le nom est composé de deux éléments formant un mot : bi- ( préfixe latin signifiant « deux ») et nomial (littéralement « nom »). En latin médiéval, le mot apparenté binôme était utilisé pour signifier un terme dans une expression binomiale en mathématiques. ^[4] Le mot nomen (nomina au pluriel) signifie ‘nom’ en latin.

Histoire

Carl Linnaeus (1707-1778), un botaniste suédois, a inventé le système moderne de nomenclature binomiale

Avant l’adoption du système binomial moderne de dénomination des espèces, un nom scientifique consistait en un nom générique combiné à un nom spécifique d’un à plusieurs mots. Ensemble, ils ont formé un système de nomenclature polynomiale. ^[5] Ces noms avaient deux fonctions distinctes. Premièrement, pour désigner ou étiqueter l’espèce, et deuxièmement, pour être un diagnostic ou une description; cependant, ces deux objectifs se sont finalement révélés incompatibles. ^[6] Dans un genre simple, contenant seulement deux espèces, il était facile de les différencier avec un genre à un mot et un nom spécifique à un mot; mais au fur et à mesure de la découverte d’espèces, les noms devenaient nécessairement plus longs et difficiles à manier, par exemple Plantago foliis ovato-lanceolatus pubescentibus, spica cylindrica, scapo tereti(“plantain à feuilles pubescentes ovales-lancéolées, à épi cylindrique et à hampe cylindrique ” ), que nous connaissons aujourd’hui sous le nom de Plantago media .

De tels “noms polynomiaux” peuvent parfois ressembler à des binômes, mais sont très différents. Par exemple, Gerard’s herbal (tel que modifié par Johnson) décrit différents types de tradescantie : “Le premier s’appelle Phalangium ramosum , Branched Spiderwort; le second, Phalangium non ramosum , Unbranched Spiderwort. L’autre … est appelé à juste titre Phalangium Ephemerum Virginianum , La Spiderwort de Virginie qui s’estompe bientôt”. ^[7] Les phrases latines sont de courtes descriptions, plutôt que des étiquettes d’identification.

Les Bauhins , en particulier Caspar Bauhin (1560-1624), ont franchi des étapes importantes vers le système binomial, en réduisant les descriptions latines, dans de nombreux cas à deux mots. ^[8] L’adoption par les biologistes d’un système de nomenclature strictement binomiale est due au botaniste et médecin suédois Carl Linnaeus (1707–1778).C’est dans Species Plantarum de Linnaeus en 1753 qu’il a commencé à utiliser systématiquement un nom trivial en un mot ( nomen triviale ) après un nom générique (nom de genre) dans un système de nomenclature binomiale. ^[9] Des noms triviaux étaient déjà apparus dans ses Critica Botanica (1737) et Philosophia Botanica (1751). Ce nom trivial est ce que l’on appelle aujourd’hui une épithète spécifique ( ICNafp ) ou un nom spécifique ( ICZN ). ^[9] Les noms de genre des Bauhins ont été retenus dans beaucoup d’entre eux, mais la partie descriptive a été réduite à un seul mot.

Les noms triviaux de Linnaeus ont introduit une nouvelle idée importante, à savoir que la fonction d’un nom pourrait simplement être de donner à une espèce une étiquette unique. Cela signifiait que le nom n’avait plus besoin d’être descriptif; par exemple, les deux parties pourraient être dérivées des noms de personnes. Ainsi le Phalangium ephemerum virginianum de Gerard est devenu Tradescantia virginiana , où le nom du genre honorait John Tradescant le Jeune , ^{[note 1]} un botaniste et jardinier anglais. ^[10] Un oiseau de la famille des perroquets a été nommé Psittacus alexandri , ce qui signifie “le perroquet d’Alexandre”, d’après Alexandre le Grand , dont les armées ont introduit les perruches orientales en Grèce. ^[11]Les noms triviaux de Linnaeus étaient beaucoup plus faciles à retenir et à utiliser que les noms polynomiaux parallèles et les ont finalement remplacés. ^[2]

Valeur

La bactérie Escherichia coli , communément abrégée en E. coli

La valeur du système de nomenclature binomiale découle principalement de son économie, de son utilisation généralisée, ainsi que de l’unicité et de la stabilité des noms que fournissent les Codes de Nomenclature zoologique et botanique , bactérienne et virale :

• Économie. Comparé au système polynomial qu’il a remplacé, un nom binomial est plus court et plus facile à retenir. ^[2] Il correspond au système répandu de Nom de famille et de prénom (s) utilisé pour nommer les personnes dans de nombreuses cultures. ^[8]
• Utilisation généralisée. Le système binomial de nomenclature est régi par des codes internationaux et est utilisé par les biologistes du monde entier. ^[12] Quelques binômes sont également entrés dans le langage courant, tels que Homo sapiens , E. coli , Boa constrictor et Tyrannosaurus rex .
• Unicité. À condition que les taxonomistes s’accordent sur les limites d’une espèce, elle ne peut avoir qu’un seul nom correct sous le Code de nomenclature approprié , généralement le plus ancien publié si deux noms ou plus sont accidentellement attribués à une espèce. ^[13] Cependant, établir que deux noms se réfèrent réellement à la même espèce et ensuite déterminer lequel a la priorité peut être difficile, en particulier si l’espèce a été nommée par des biologistes de différents pays. Par conséquent, une espèce peut avoir plus d’un nom régulièrement utilisé; tous ces noms sauf un sont des ” synonymes “. ^[14] De plus, dans la zoologie ou la botanique, chaque nom d’espèce s’applique à une seule espèce. Si un nom est utilisé plus d’une fois, on l’appelle un homonyme. Erithacus rubecula superbus , le merle de Tenerife ou petirrojo
• La stabilité. Bien que la stabilité soit loin d’être absolue, les procédures associées à l’établissement des noms binomiaux, comme le principe de priorité, tendent à favoriser la stabilité. ^[15] Par exemple, lorsque des espèces sont transférées entre genres (ce qui n’est pas rare à la suite de nouvelles connaissances), la deuxième partie du binôme est conservée (à moins qu’elle ne devienne un homonyme). Ainsi, les botanistes ne sont pas d’accord sur la question de savoir si les genres Chionodoxa et Scilla sont suffisamment différents pour être séparés. Ceux qui les séparent donnent à la plante communément cultivée dans les jardins d’Europe le nom de Chionodoxa siehei ; ceux qui ne lui donnent pas le nom de Scilla siehei . ^[16] Lel’élément siehei est constant. De même, si ce que l’on pensait auparavant être deux espèces distinctes est rétrogradé à un rang inférieur, comme une sous-espèce, la deuxième partie du nom binomial est conservée comme trinôme (la troisième partie du nouveau nom). Ainsi, le rouge-gorge de Tenerife peut être traité comme une espèce différente du rouge-gorge européen, auquel cas son nom est Erithacus superbus , ou comme une sous-espèce uniquement, auquel cas son nom est Erithacus rubecula superbus . ^[17] L’ élément superbus du nom est constant, tout comme sa paternité et son année de publication.

Problèmes

La nomenclature binomiale des espèces a pour effet que lorsqu’une espèce est déplacée d’un genre à un autre, le nom ou l’épithète spécifique doit parfois également être modifié. Cela peut arriver parce que le nom spécifique est déjà utilisé dans le nouveau genre, ou pour s’accorder en genre avec le nouveau genre si l’épithète spécifique est un adjectif modifiant le nom du genre. Certains biologistes ont plaidé pour la combinaison du nom du genre et de l’épithète spécifique en un seul nom sans ambiguïté, ou pour l’utilisation d’uninomiaux (tels qu’utilisés dans la nomenclature des rangs au-dessus des espèces). ^{[18] [19]}

Étant donné que les noms de genre ne sont uniques que dans un Code de nomenclature, il est possible que deux espèces ou plus partagent le même nom de genre et même le même binôme s’ils se produisent dans des règnes différents. Au moins 1 240 cas de duplication de noms de genre se produisent (principalement entre la zoologie et la botanique). ^{[20] [21]}

Relation avec la classification et la taxonomie

La nomenclature (y compris la nomenclature binomiale) n’est pas la même chose que la classification, bien que les deux soient liées. La classification est le classement des éléments en groupes en fonction des similitudes ou des différences ; dans la classification biologique , les espèces sont l’un des types d’éléments à classer. ^[22]En principe, les noms donnés aux espèces pourraient être totalement indépendants de leur classification. Ce n’est pas le cas pour les noms binomiaux, puisque la première partie d’un binôme est le nom du genre dans lequel l’espèce est placée. Au-dessus du rang de genre, nomenclature et classification binomiales sont en partie indépendantes ; par exemple, une espèce conserve son nom binomial si elle est déplacée d’une famille à une autre ou d’un ordre à un autre, à moins qu’elle ne corresponde mieux à un genre différent dans la même famille ou dans une famille différente, ou qu’elle soit séparée de son ancien genre et placée dans un genre nouvellement créé. L’indépendance n’est que partielle puisque les noms de familles et d’autres taxons supérieurs sont généralement basés sur des genres. ^{[ citation nécessaire ]}

La taxonomie comprend à la fois la nomenclature et la classification. Ses premières étapes (parfois appelées « Taxonomie alpha ») concernent la recherche, la description et la dénomination d’espèces d’organismes vivants ou fossiles . ^[23] La nomenclature binomiale est donc une partie importante de la taxonomie car c’est le système par lequel les espèces sont nommées. Les taxonomistes s’intéressent également à la classification, y compris ses principes, ses procédures et ses règles. ^[24]

Dérivation des noms binomiaux

Un nom binomial complet est toujours traité grammaticalement comme s’il s’agissait d’une phrase en langue latine (d’où l’utilisation courante du terme “nom latin” pour un nom binomial). Cependant, les deux parties d’un nom binomial peuvent chacune provenir d’un certain nombre de sources, dont le latin n’est qu’une. Ceux-ci inclus:

• Latin, qu’il soit classique ou médiéval . Ainsi, les deux parties du nom binomial Homo sapiens sont des mots latins, signifiant « sage » ( sapiens ) « humain/homme » ( Homo ).
• Grec classique . Le genre Rhododendron a été nommé par Linnaeus du mot grec ῥοδόδενδρον , lui-même dérivé de rhodon , “rose”, et de dendron , “arbre”. ^{[25] [26]} Les mots grecs sont souvent convertis en une forme latinisée. Ainsi la coca (la plante à partir de laquelle la cocaïne est obtenue) porte le nom d’ Erythroxylum coca . Erythroxylum est dérivé des mots grecs erythros , rouge, et xylon , bois. ^[27] La ​​terminaison neutre grecque – ον (-on) est souvent convertie en terminaison neutre latine -um. ^{[note 2]}
• Autres langues. La deuxième partie du nom Erythroxylum coca est dérivée de kuka , le nom de la plante en aymara et en quechua . ^{[28] [29]} Comme de nombreux fossiles de dinosaures ont été trouvés en Mongolie, leurs noms utilisent souvent des mots mongols , par exemple Tarchia de tarkhi , signifiant “cerveau”, ou Saichania signifiant “beau”.
• Noms de personnes (souvent naturalistes ou biologistes). Le nom Magnolia campbellii commémore deux personnes : Pierre Magnol , un botaniste français, et Archibald Campbell , un médecin de l’Inde britannique . ^[30]
• Noms de lieux. La tique étoile solitaire, Amblyomma americanum , est répandue aux États-Unis. ^[31]
• Autres sources. Certains noms binomiaux ont été construits à partir d’ anagrammes taxonomiques ou d’autres réorganisations de noms existants. Ainsi le nom du genre Muilla est dérivé en inversant le nom Allium . ^[32] Les noms peuvent également être dérivés de Blagues ou de jeux de mots . Par exemple, Ratcliffe a décrit un certain nombre d’espèces de scarabées rhinocéros , dont Cyclocephala nodanotherwon . ^[33]

La première partie du nom, qui identifie le genre, doit être un mot qui peut être traité comme un nom latin singulier au nominatif . Il doit être unique au sein de chaque code nomenclatural , mais peut être répété entre eux. Ainsi Huia recurvata est une espèce de plante éteinte, trouvée sous forme de fossiles dans le Yunnan , en Chine, ^[34] alors que Huia masonii est une espèce de grenouille trouvée à Java , en Indonésie. ^[35]

La deuxième partie du nom, qui identifie l’espèce au sein du genre, est également traitée grammaticalement comme un mot latin. Il peut avoir plusieurs formes :

• La deuxième partie d’un binôme peut être un adjectif. L’adjectif doit s’accorder avec le nom du genre en genre . Le latin a trois genres, masculin, féminin et neutre, représentés par des terminaisons variables des noms et des adjectifs. Le moineau domestique porte le nom binomial Passer domesticus . Ici, domesticus (“domestique”) signifie simplement “associé à la maison”. Le bambou sacré est Nandina domestique a ^[36] plutôt que Nandina domestique nous , puisque Nandina est féminin alors que Passer est masculin. Le langsat aux fruits tropicaux est un produit de la planteLansium parasite um , puisque Lansium est neutre. Certaines terminaisons courantes pour les adjectifs latins dans les trois genres (masculin, féminin, neutre) sont -us , -a , -um (comme dans l’exemple précédent de domesticus ); -is , -is , -e (par exemple tristis , signifiant “triste”); et -or , -or , -us (par exemple minor , signifiant “plus petit”). Pour plus d’informations, voir Déclinaison latine : Adjectifs .
• La deuxième partie d’un binôme peut être un nom au nominatif. Un exemple est le nom binomial du lion, qui est Panthera leo . Grammaticalement, on dit que le nom est en apposition au nom du genre et les deux noms n’ont pas à s’accorder en genre; dans ce cas, Panthera est féminin et leo est masculin.

Magnolia hodgsonii

• La deuxième partie d’un binôme peut être un nom dans le cas génitif (possessif). Le cas génitif est construit de plusieurs façons en latin, selon la déclinaison du nom. Les terminaisons courantes pour les noms masculins et neutres sont -ii ou -i au singulier et -orum au pluriel, et pour les noms féminins -ae au singulier et -arum au pluriel. Le nom peut faire partie du nom d’une personne, souvent le Nom de famille, comme dans l’ antilope tibétaine ( Pantholops hodgsonii ), l’arbuste Magnolia hodgsonii ou le pipit à dos olive ( Anthus hodgsoni). Le sens est “de la personne nommée”, de sorte que Magnolia hodgsonii signifie “magnolia de Hodgson”. Les terminaisons -ii ou -i montrent que dans chaque cas Hodgson était un homme (pas le même) ; si Hodgson avait été une femme, hodgsonae aurait été utilisé. La personne commémorée dans le nom binomial n’est généralement pas (voire jamais) la personne qui a créé le nom; par exemple Anthus hodgsoni a été nommé par Charles Wallace Richmond , en l’honneur de Hodgson. Plutôt qu’une personne, le nom peut être lié à un lieu, comme avec Latimeria chalumnae , signifiant “de la rivière Chalumna “. Une autre utilisation des noms génitifs est, par exemple, le nom de la bactérieEscherichia coli , où coli signifie « du côlon ». Cette formation est fréquente chez les parasites, comme chez Xenos vesparum , où vesparum signifie « des guêpes », puisque Xenos vesparum est un parasite des guêpes.

Alors que la première partie d’un nom binomial doit être unique dans le cadre de chaque code nomenclatural, la deuxième partie est assez couramment utilisée dans deux genres ou plus (comme le montrent les exemples de hodgsonii ci-dessus). Le nom binomial complet doit être unique dans chaque code.

Codes

À partir du début du XIXe siècle, il est devenu de plus en plus évident qu’un corps de règles était nécessaire pour régir les noms scientifiques. Au fil du temps, ceux-ci sont devenus des codes de nomenclature . Le Code international de Nomenclature zoologique ( ICZN ) régit la dénomination des animaux ^[37] , le Code international de nomenclature des algues, des champignons et des plantes ( ICNafp ) celle des plantes (y compris les cyanobactéries ) et le Code international de nomenclature des bactéries ( ICNB ) celle des bactéries (dont Archaea ). Les noms de virus sont régis par leInternational Committee on Taxonomy of Viruses ( ICTV ), un code taxonomique, qui détermine les taxons ainsi que les noms. Ces codes diffèrent à certains égards, par exemple :

• La “nomenclature binomiale” est le terme correct pour la botanique, ^[38] bien qu’il soit également utilisé par les zoologistes. ^[39] Depuis 1953, la “nomenclature binomi n ale ” est le terme techniquement correct en zoologie. Un nom binominal est aussi appelé binôme (pluriel binomina). ^[40]
• Les deux codes considèrent que la première partie du nom en deux parties d’une espèce est le “nom générique”. Dans le code zoologique ( ICZN ), la deuxième partie du nom est un “nom spécifique”. Dans le code botanique ( ICNafp ), il s’agit d’une « épithète spécifique ». Ensemble, ces deux parties sont appelées «nom d’espèce» ou «binôme» dans le code zoologique; ou “nom de l’espèce”, “binôme” ou “combinaison binaire” dans le code botanique. “Nom de l’espèce” est le seul terme commun aux deux codes.
• L ‘ ICNafp , le code végétal, ne permet pas que les deux parties d’un nom binomial soient identiques (un tel nom s’appelle un tautonyme ), contrairement à l ‘ ICZN , le code animal. Ainsi le bison d’Amérique a pour binôme Bison bison ; un nom de ce genre ne serait pas autorisé pour une plante.
• Les points de départ, le moment à partir duquel ces codes sont en vigueur (rétroactivement), varient d’un groupe à l’autre. En botanique , le point de départ sera souvent en 1753 (l’année où Carl Linnaeus a publié pour la première fois Species Plantarum ). En zoologie , le point de départ est 1758 (le 1er janvier 1758 est considéré comme la date de publication du Systema Naturae de Linnaeus , 10e édition, ainsi que des Aranei Svecici de Clerck ). La bactériologie a recommencé, avec un point de départ le 1er janvier 1980. ^[41]

Résumé de la terminologie des noms d’espèces dans l’ICZN et l’ICNafp

Code	Nom complet	Première partie	Deuxième partie
ICZN	nom d’espèce, binôme, nom binominal	nom générique, nom de genre	nom spécifique
ICNafp	nom d’espèce, combinaison binaire, binôme (nom)	nom générique	épithète spécifique

L’unification des différents codes en un seul code, le ” BioCode “, a été suggérée, mais la mise en œuvre n’est pas en vue. (Il existe également un code publié pour un système différent de nomenclature biotique qui n’utilise pas les rangs au-dessus des espèces, mais nomme plutôt les clades . C’est ce qu’on appelle le PhyloCode .)

Différences dans le traitement des noms personnels

Comme indiqué ci-dessus, il existe certaines différences entre les codes dans la manière dont les binômes peuvent être formés; par exemple, l’ ICZN permet aux deux parties d’être identiques, contrairement à l’ ICNafp . Une autre différence réside dans la manière dont les noms personnels sont utilisés pour former des noms ou des épithètes spécifiques. L’ ICNafp énonce des règles précises selon lesquelles un nom personnel doit être converti en une épithète spécifique. En particulier, les noms se terminant par une consonne (mais pas “er”) sont traités comme étant d’abord convertis en latin en ajoutant “-ius” (pour un homme) ou “-ia” (pour une femme), puis étant rendus génitifs (c’est-à-dire signifiant “de cette personne ou de ces personnes”). Cela produit des épithètes spécifiques comme lecardii pour Lecard (mâle), wilsoniaepour Wilson (femelle) et brauniarum pour les sœurs Braun. ^[42] En revanche, l’ ICZN n’exige pas la création intermédiaire d’une forme latine d’un nom personnel, permettant d’ajouter directement la terminaison génitive au nom personnel. ^[43] Ceci explique la différence entre les noms de la plante Magnolia hodgsonii et de l’oiseau Anthus hodgsoni . De plus, l’ ICNafp exige que les noms non publiés sous la forme requise par le code soient corrigés pour s’y conformer ^[44] , alors que l’ ICZN protège davantage la forme utilisée par l’auteur original. ^[45]

Écrire des noms binomiaux

Par tradition, les noms binomiaux des espèces sont généralement composés en italique ; par exemple, Homo sapiens . ^[46] En règle générale, le binôme doit être imprimé dans un style de police différent de celui utilisé dans le texte normal ; par exemple, ” Plusieurs autres fossiles d’ Homo sapiens ont été découverts “. Lorsqu’il est écrit à la main, un nom binomial doit être souligné; par exemple, Homo sapiens . ^[47]

La première partie du binôme, le nom du genre, s’écrit toujours avec une majuscule initiale. Les sources plus anciennes, en particulier les travaux botaniques publiés avant les années 1950, utilisent une convention différente. Si la deuxième partie du nom est dérivée d’un nom propre, par exemple le nom d’une personne ou d’un lieu, une lettre majuscule a été utilisée. Ainsi la forme moderne Berberis darwinii a été écrite comme Berberis Darwinii . Une majuscule était également utilisée lorsque le nom est formé de deux noms en apposition, par exemple Panthera Leo ou Centaurea Cyanus . ^{[48] ​​[note 3]} Dans l’usage courant, la deuxième partie ne s’écrit jamais avec une majuscule initiale. ^{[50] [51]}

Lorsqu’il est utilisé avec un nom commun, le nom scientifique suit souvent entre parenthèses, bien que cela varie selon la publication. ^[52] Par exemple, “Le moineau domestique ( Passer domesticus ) est en déclin en Europe.”

Le nom binomial doit généralement être écrit en toutes lettres. L’exception à cela est lorsque plusieurs espèces du même genre sont répertoriées ou discutées dans le même article ou rapport, ou lorsque la même espèce est mentionnée à plusieurs reprises; auquel cas le genre est écrit en entier lors de sa première utilisation, mais peut ensuite être abrégé en une initiale (et un point / point). ^[53] Par exemple, une liste de membres du genre Canis pourrait s’écrire ” Canis lupus , C. aureus , C. simensis “. Dans de rares cas, cette forme abrégée s’est étendue à un usage plus général; par exemple, la bactérie Escherichia coli est souvent appelée simplement E. coli et Tyrannosaurus rexest peut-être encore mieux connu simplement sous le nom de T. rex , ces deux-là apparaissant souvent sous cette forme dans l’écriture populaire même lorsque le nom complet du genre n’a pas encore été donné.

L’abréviation “sp.” est utilisé lorsque le nom spécifique réel ne peut pas ou n’a pas besoin d’être spécifié. L’abréviation “spp.” (pluriel) indique “plusieurs espèces”. Ces abréviations ne sont pas en italique (ni soulignées). ^{[54] [55]} Par exemple : « Canis sp. signifie « une espèce non précisée du genre Canis », tandis que « Canis spp. signifie “deux ou plusieurs espèces du genre Canis “. (Ces abréviations ne doivent pas être confondues avec les abréviations « ssp. » (zoologie) ou « subsp. » (botanique), pluriels « sspp. » ou « subspp. », faisant référence à une ou plusieurs sous- espèces .

L’abréviation « cf. » (c’est-à-dire confer en latin) est utilisée pour comparer des individus/taxons avec des espèces connues/décrites. Conventions d’utilisation du “cf.” qualificatif varient. ^[56] En paléontologie, il est généralement utilisé lorsque l’identification n’est pas confirmée. ^[57] Par exemple, ” Corvus cf. nasicus ” a été utilisé pour indiquer ” un oiseau fossile semblable à la corneille cubaine mais pas certainement identifié comme cette espèce “. ^[58]Dans les articles de systématique moléculaire, “cf.” peut être utilisé pour indiquer une ou plusieurs espèces non décrites supposées apparentées à une espèce décrite. Par exemple, dans un article décrivant la phylogénie de petits poissons d’eau douce benthiques appelés dards, cinq espèces putatives non décrites (Ozark, Sheltowee, Wildcat, Ihiyo et Mamequit dards), remarquables pour les mâles nuptiaux aux couleurs vives avec des motifs de couleur distinctifs, ^[59] ont été appelés ” Etheostoma cf. spectabile ” parce qu’ils avaient été considérés comme liés à, mais distincts de, Etheostoma spectabile (dard à gorge orange). ^[60] Ce point de vue a été soutenu à des degrés divers par l’analyse de l’ADN. L’utilisation quelque peu informelle des noms de taxons avec des abréviations qualificatives est appeléenomenclature ouverte et non soumise à des codes d’usage stricts.

Dans certains contextes, le symbole du poignard (“†”) peut être utilisé avant ou après le nom binomial pour indiquer que l’espèce est éteinte.

Autorité

Dans les textes savants, au moins la première ou principale utilisation du nom binomial est généralement suivie de «l’autorité» – une manière de désigner le ou les scientifiques qui ont publié le nom en premier. L’autorité est écrite de manière légèrement différente en zoologie et en botanique. Pour les noms régis par l’ ICZN , le Nom de famille est généralement écrit en entier avec la date (normalement uniquement l’année) de publication. L’ ICZN recommande que “l’auteur original et la date d’un nom soient cités au moins une fois dans chaque ouvrage traitant du taxon désigné par ce nom”. ^[61] Pour les noms régis par l’ ICNafp, le nom est généralement réduit à une abréviation standard et la date omise. L’ Index international des noms de plantestient à jour une liste approuvée des abréviations des auteurs botaniques. Historiquement, les abréviations étaient également utilisées en zoologie.

Lorsque le nom d’origine est modifié, par exemple l’espèce est déplacée vers un genre différent, les deux codes utilisent des parenthèses autour de l’autorité d’origine ; l’ ICNafp exige également que la personne qui a effectué le changement soit indiquée. Dans l’ ICNafp , le nom d’origine est alors appelé le basionyme . Quelques exemples:

• (Plante) Amaranthus retroflexus L. – “L.” est l’abréviation standard de “Linnaeus” ; l’absence de parenthèses montre qu’il s’agit de son nom d’origine.
• (Plante) Hyacinthoides italica (L.) Rothm. – Linnaeus a d’abord nommé la jacinthe des bois italienne Scilla italica ; c’est le basionyme. Rothmaler l’ a ensuite transféré au genre Hyacinthoides .
• (Animal) Passer domesticus (Linnaeus, 1758) – le nom original donné par Linnaeus était Fringilla domestica ; contrairement à l’ ICNafp , l ‘ ICZN n’exige pas que le nom de la personne qui a changé le genre ( Mathurin Jacques Brisson ^[62] ) soit donné.

Autres rangs

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La nomenclature binomiale, telle que décrite ici, est un système de dénomination des espèces. Il comprend implicitement un système de dénomination des genres, puisque la première partie du nom de l’espèce est un nom de genre. Dans un système de classification basé sur les rangs, il existe également des moyens de nommer les rangs au-dessus du niveau du genre et en dessous du niveau de l’espèce. Les rangs au-dessus du genre (par exemple, famille, ordre, classe) reçoivent des noms en une partie, qui ne sont généralement pas écrits en italique. Ainsi le moineau domestique, Passer domesticus , appartient à la famille des Passeridae . Les noms de famille sont normalement basés sur les noms de genre, bien que les terminaisons utilisées diffèrent entre la zoologie et la botanique.

Les rangs inférieurs aux espèces reçoivent des noms en trois parties, écrits de manière conventionnelle en italique comme les noms d’espèces. Il existe des différences significatives entre l’ ICZN et l’ ICNafp . En zoologie, le seul rang sous l’espèce est la sous-espèce et le nom s’écrit simplement en trois parties (un trinôme). Ainsi l’une des sous-espèces du pipit à dos olive est Anthus hodgsoni berezowskii . En botanique , il existe de nombreux rangs sous les espèces et bien que le nom lui-même soit écrit en trois parties, un «terme de connexion» (ne faisant pas partie du nom) est nécessaire pour indiquer le rang. Ainsi le sureau noir américain est Sambucus nigra subsp. canadensis ; la forme à fleurs blanches du cyclamen à feuilles de lierre estCyclamen hederifolium f. albiflore .

Voir également

• Glossaire des dénominations scientifiques
• nom botanique
• Nom hybride (botanique)
• Liste des botanistes par abréviation d’auteur
• Liste des mots latins et grecs couramment utilisés dans les noms systématiques
• Liste des organismes nommés d’après des personnes célèbres
• Liste des zoologistes par abréviation d’auteur
• Terminologie scientifique
• Description de l’espèce
• Taxon non décrit

Remarques

1. ↑ Certaines sources disent que John Tradescant le Jeune et son père, John Tradescant l’Ancien , étaient destinés à Linnaeus.
2. ↑ La terminaison “-on” peut dériver de la terminaison grecque neutre – ον , comme dans Rhodoxylon floridum , ou de la terminaison grecque masculine – ων , comme dans Rhodochiton atrosanguineus .
3. ↑ Certains ont résisté à la notation moderne, en partie parce que l’écriture de noms comme Centaurea cyanus peut suggérer que cyanus est un adjectif qui devrait s’accorder avec Centaurea , c’est-à-dire que le nom devrait être Centaurea cyana , alors que Cyanus est dérivé du nom grec du bleuet. ^[49]

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Liens externes

• Curiosités de nomenclature biologique
• Base de données de taxonomie NCBI
• Crinan, Alexandre, éd. (2007), Plant Names : A Guide for Horticulturists, Nurserymen, Gardeners and Students (PDF) , Horticultural Taxonomy Group , Royal Botanic Garden Edinburgh, archivé de l’original (PDF) le 27 septembre 2013 , récupéré le 4 juin 2013